RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1B0GX30 115 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TOR1AO14656 332 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 YPEL1O60688 119 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 DIRAS3O95661 229 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ARG1P05089 322 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 AKAIN1P0CW23 69 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 OR5H8P0DN80 308 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 IL7P13232 177 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 CD40LGP29965 261 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 UBE2E1P51965 193 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 PPP5CP53041 499 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 MORN2Q502X0 79 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 GPR157Q5UAW9 335 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 OR9G1Q8NH87 305 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 YPEL2Q96QA6 119 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC32Q9BV29 185 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 RDH8Q9NYR8 311 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 PSG11Q9UQ72 335 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ABCA1O95477 2261 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 J3QR06 171 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 SLC31A2O15432 143 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 RAB3DO95716 219 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV1-69P01742 117 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 CD74P04233 296 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 IFNA6P05013 189 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TBPP20226 339 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 HNF1AP20823 631 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 CD34P28906 385 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 FCGR2CP31995 323 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF134P52741 427 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 PRRX1P54821 245 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 AP3S2P59780 193 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TSPAN5P62079 268 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 DYRK1AQ13627 763 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 MEF2DQ14814 521 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 VAX1Q5SQQ9 334 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF626Q68DY1 528 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 NANPQ8TBE9 248 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF596Q8TC21 504 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 MMP28Q9H239 520 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ACANP16112 2415 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ZFHX3Q15911 3703 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 ODF3BA8MYP8 253 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 DISC1C4P0D8 188 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 NPFFO15130 113 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 UPK1BO75841 260 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 PPYP01298 95 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 IGLV1-47P01700 117 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 AMY2AP04746 511 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 AADACP22760 399 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 SAA4P35542 130 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 LGALS4P56470 323 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 FXYD4P59646 89 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 HERV-K104P61576 105 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 Q3ZCU0 254 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM17Q86X19 198 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 LYG1Q8N1E2 194 aa6.92□□□□□ -1.3
SGMS1-211ENST00000626236 TEX29Q8N6K0 151 aa6.92□□□□□ -1.3
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