RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589727.5

ATP6V0A1-222, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit a1, human

TSL 5

Gene ATP6V0A1, Length 664 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ASRGL1	Q7L266	308 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RNF148	Q8N7C7	305 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR4K13	Q8NH42	304 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GALNT14	Q96FL9	552 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NIPAL2	Q9H841	368 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SAR1A	Q9NR31	198 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CMTM6	Q9NX76	183 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SNX3	O60493	162 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GMNN	O75496	209 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GADD45G	O95257	159 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	EDN2	P20800	178 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FMO3	P31513	532 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	AES	Q08117	197 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TSPAN31	Q12999	210 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LTC4S	Q16873	150 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		Q8NAQ8	132 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C7orf34	Q96L11	122 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RDH12	Q96NR8	316 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LRRC42	Q9Y546	428 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DHRS12	A0PJE2	317 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		F8VVB4	439 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		F8VWA3	439 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IFNG	P01579	166 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SEMG1	P04279	462 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PSKH1	P11801	424 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	AADAC	P22760	399 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MPZ	P25189	248 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IL3RA	P26951	378 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PYCR1	P32322	319 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GSS	P48637	474 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NUDT2	P50583	147 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CX3CL1	P78423	397 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DLK1	P80370	383 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM187	Q14656	261 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	POC5	Q8NA72	575 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LFNG	Q8NES3	379 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR5B3	Q8NH48	314 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM210B	Q96KR6	192 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CEP19	Q96LK0	163 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		A0A087WWL8	130 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		A0A0U1RQV1	116 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TVP23A	A6NH52	213 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SIRPB1	O00241	398 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NBR2	O15453	112 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CCDC22	O60826	627 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ATP5H	O75947	161 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KRT36	O76013	467 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DIRAS1	O95057	198 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FABP3	P05413	133 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF3	P17036	446 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SPI1	P17947	270 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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