RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, human

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-208	ENST00000589162	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	LRBA	P50851	2863 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	FUOM	A2VDF0	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	F2RL2	O00254	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	SPINT2	O43291	252 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	HSPA12A	O43301	675 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TNFSF12	O43508	249 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TPPP	O94811	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	LIPF	P07098	398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR8U9	P0C7N5	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR5H8	P0DN80	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	MMP9	P14780	707 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	PGAM2	P15259	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	FPR2	P25090	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	KIR2DS4	P43632	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	REG1B	P48304	166 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TSPAN5	P62079	268 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	PAX5	Q02548	391 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	KIR2DS1	Q14954	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	MORN2	Q502X0	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR8U1	Q8NH10	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	C17orf50	Q8WW18	174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TNFRSF14	Q92956	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	LHX4	Q969G2	390 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	GALM	Q96C23	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ARID1A	O14497	2285 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	COL12A1	Q99715	3063 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	DISC1	C4P0D8	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162		H3BUI4	141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	PROP1	O75360	226 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	TOX4	O94842	621 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	LY6G6D	O95868	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	PPY	P01298	95 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	IFNA6	P05013	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	HEXA	P06865	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	GZMH	P20718	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	TAS2R46	P59540	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	HERV-K104	P61576	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	PAX8	Q06710	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	ASAH1	Q13510	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162		Q3ZCU0	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAPNS1-208	ENST00000589162	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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