RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 GHITMQ9H3K2 345 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 J3QR06 171 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 DNPH1O43598 174 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 TFF2Q03403 129 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 OR2J1Q9GZK6 312 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 CBLN4Q9NTU7 201 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PQF6 199 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF137PP52743 207 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 RUNX1Q01196 453 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 OR1L8Q8NGR8 309 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 PRSS53Q2L4Q9 553 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 RND1Q92730 232 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 TTTY12Q9BZ98 90 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 A0A0U1RQV5 110 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 MGPP08493 103 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 BCL2P10415 239 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 FAM222BQ8WU58 562 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 FUT5Q11128 374 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 OR8I2Q8N0Y5 310 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 CD1BP29016 333 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 PSG4Q00888 419 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 MYOZ3Q8TDC0 251 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV4-34P06331 123 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 STXBP6Q8NFX7 210 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 FAM27BQ5VT28 67 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 SOSTQ9BQB4 213 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 WIPI2Q9Y4P8 454 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF831Q5JPB2 1677 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 SOD3P08294 240 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 REG1BP48304 166 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 MTURNQ8N3F0 131 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 C1RLQ9NZP8 487 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 TMUB1Q9BVT8 246 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 PMCHL1Q16048 86 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 CEACAM21Q3KPI0 293 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 TEX30Q5JUR7 227 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 DCAF10Q5QP82 559 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 UBTD1Q9HAC8 227 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 A0A0J9YW62 118 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 HPRT1P00492 218 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 PRDX2P32119 198 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 GBGT1Q8N5D6 347 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 FBLIM1Q8WUP2 373 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 SLC25A33Q9BSK2 321 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 PRNTQ86SH4 94 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 WNT2BQ93097 391 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 AMELYQ99218 206 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 WFDC6Q9BQY6 131 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 PAXXQ9BUH6 204 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 NGFRP08138 427 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 GGACTQ9BVM4 153 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 CLDN14O95500 239 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 GCSHP23434 173 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 PATE3B3GLJ2 98 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 CFDP00746 253 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 HIGD1AQ9Y241 93 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PP11 408 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 M0R3E3 92 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 TTC32Q5I0X7 151 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 H0Y980 276 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 HTN1P15515 57 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 CLDN18P56856 261 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 PCGF1Q9BSM1 259 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 SERF2P84101 59 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 MARVELD3Q96A59 401 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 TLNRD1Q9H1K6 362 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 SCGB1A1P11684 91 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 PILRAQ9UKJ1 303 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 PQLC2LA1A4F0 135 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 TSPAN2O60636 221 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 LMX1BO60663 402 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 FGF12P61328 243 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 TPRX1Q8N7U7 411 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 IL19Q9UHD0 177 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 PXMP4Q9Y6I8 212 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-211ENST00000580170 ERGP11308 486 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms