RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	RANBP1	P43487	201 aa		7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	MAP2K4	P45985	399 aa		7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR12	P47775	334 aa		7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	HSPA13	P48723	471 aa		7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	PSMD7	P51665	324 aa		7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	F2RL1	P55085	397 aa		7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	QRFP	P83859	136 aa		7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	UNC119	Q13432	240 aa		7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	GNMT	Q14749	295 aa		7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	P2RY14	Q15391	338 aa		7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	HMGN3	Q15651	99 aa		7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	TEX38	Q6PEX7	206 aa		7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	SETD6	Q8TBK2	473 aa		7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	MRAP	Q8TCY5	172 aa		7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	NICN1	Q9BSH3	213 aa		7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNK15	Q9H427	330 aa		7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		7.41	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A0A6YYD4	124 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	NUDT19	A8MXV4	375 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC17A2	O00624	439 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	SOCS1	O15524	211 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	NAPSA	O96009	420 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC6A1	P30531	599 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	SOX6	P35712	828 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	MYCNOS	P40205	109 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	THBS3	P49746	956 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	FABP5	Q01469	135 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	LSAMP	Q13449	338 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	RAB11B	Q15907	218 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479		Q6ZPA2	131 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	SVOP	Q8N4V2	548 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	CNBD2	Q96M20	576 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	GFI1	Q99684	422 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479		V9GY05	133 aa		7.4	□□□□□ -1.22
KIFC3-231	ENST00000567479	PLXNB1	O43157	2135 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	RAB29	O14966	203 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	VDAC1	P21796	283 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	VEGFC	P49767	419 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM50B	P56557	158 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	ACTB	P60709	375 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	MMD	Q15546	238 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF695	Q8IW36	515 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	RITA1	Q96K30	269 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	NABP2	Q9BQ15	211 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	GHITM	Q9H3K2	345 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	AK3	Q9UIJ7	227 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	HSF4	Q9ULV5	492 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	RAB26	Q9ULW5	256 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		7.39	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	ITGB1BP1	O14713	200 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	PDCD5	O14737	125 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	ST8SIA5	O15466	376 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	HSPA12A	O43301	675 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	IGF1	P05019	195 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	ELANE	P08246	267 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	OR5H8	P0DN80	308 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	ZBTB25	P24278	435 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	CEACAM6	P40199	344 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	OR3A3	P47888	321 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	CLDN12	P56749	244 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	FOXE3	Q13461	319 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
KIFC3-231	ENST00000567479	LIN54	Q6MZP7	749 aa		7.38	□□□□□ -1.23

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