RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		15.56	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		15.56	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		15.56	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	15.56	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		15.56	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PPE3	182 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF806	P0C7X5	589 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	IAPP	P10997	89 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	LILRB2	Q8N423	598 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	DRAM1	Q8N682	238 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	15.55	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	RPRM	Q9NS64	109 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	15.55	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	COL6A3	P12111	3177 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559		H0YL77	283 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	15.55	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	B2M	P61769	119 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB123	Q8N688	67 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		15.55	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		15.54	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	CBR1	P16152	277 aa		15.54	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	15.54	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF787	Q6DD87	383 aa		15.54	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	15.54	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		15.54	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	RSG1	Q9BU20	258 aa		15.54	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	GNG13	Q9P2W3	67 aa		15.54	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	C3orf80	F5H4A9	247 aa		15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	HAND1	O96004	215 aa		15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	CELA3B	P08861	270 aa		15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	BCL2	P10415	239 aa		15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	FGFRL1	Q8N441	504 aa		15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	GALM	Q96C23	342 aa		15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	NCOR1	O75376	2440 aa		15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	MSMO1	Q15800	293 aa		15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	HES3	Q5TGS1	186 aa		15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	DHRS13	Q6UX07	377 aa		15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	VASH2	Q86V25	355 aa		15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	P2RX4	Q99571	388 aa		15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	HES4	Q9HCC6	221 aa		15.53	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	FBP1	P09467	338 aa		15.52	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	NQO2	P16083	231 aa		15.52	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV1-2	P23083	117 aa		15.52	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	15.52	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	GLIPR1	P48060	266 aa		15.52	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	IGFBP7	Q16270	282 aa		15.52	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	15.52	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	IFNA1	P01562	189 aa		15.52	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	GRP	P07492	148 aa		15.52	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	SOX8	P57073	446 aa		15.52	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	ARL16	Q0P5N6	197 aa		15.52	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	PSG7	Q13046	419 aa		15.52	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	PMS2P11	Q13670	270 aa		15.52	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	ELOB	Q15370	118 aa		15.52	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		15.52	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		15.52	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		15.52	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	15.52	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	OOEP	A6NGQ2	149 aa		15.51	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF727	A8MUV8	499 aa		15.51	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	TNFRSF9	Q07011	255 aa		15.51	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	CATR1	Q13166	79 aa		15.51	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		15.51	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		15.51	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	NANP	Q8TBE9	248 aa		15.51	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		15.51	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		15.51	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		15.51	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559		R4GN57	208 aa		15.51	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	MUC3A	Q02505	3323 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	TUBG1	P23258	451 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	IL2RG	P31785	369 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	ERVS71-1	P61550	626 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	RAB11A	P62491	216 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZT83	130 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	UBALD1	Q8TB05	177 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	NINJ1	Q92982	152 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		15.5	■□□□□ 0.07
RRN3-205	ENST00000563559	ZFP92	A6NM28	416 aa		15.5	■□□□□ 0.07

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