RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		17.18	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	S1PR3	Q99500	378 aa		17.18	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		17.18	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		17.18	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		17.18	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		17.17	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	SOCS1	O15524	211 aa		17.17	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	PF4V1	P10720	104 aa		17.17	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR12	P47775	334 aa		17.17	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	F2RL1	P55085	397 aa		17.17	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		17.17	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		17.17	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		17.17	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		17.17	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM50B	P56557	158 aa		17.16	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	LSAMP	Q13449	338 aa		17.16	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB11B	Q15907	218 aa		17.16	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		17.16	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	STPG2	Q8N412	459 aa		17.16	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	17.16	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	LDLRAD4	O15165	306 aa		17.15	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP6V1G2	O95670	118 aa		17.15	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	CLDN12	P56749	244 aa		17.15	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		17.15	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		17.15	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		17.15	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		17.15	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		17.15	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	HSF4	Q9ULV5	492 aa		17.15	■□□□□ 0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	RGS11	O94810	467 aa		17.14	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	17.14	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	17.14	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		17.14	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		17.14	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PHF21A	Q96BD5	680 aa		17.14	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		17.14	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	NABP2	Q9BQ15	211 aa		17.14	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	17.14	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		17.14	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		17.14	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	AK3	Q9UIJ7	227 aa		17.14	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200		V9GY05	133 aa		17.14	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	SHISA3	A0PJX4	238 aa		17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	AP4M1	O00189	453 aa		17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	CD33	P20138	364 aa		17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	OR3A3	P47888	321 aa		17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	COMMD1	Q8N668	190 aa		17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PF4	P02776	101 aa		17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLL1	P15814	213 aa		17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMD7	P51665	324 aa		17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	GABARAPL2	P60520	117 aa		17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	RITA1	Q96K30	269 aa		17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFP57	Q9NU63	452 aa		17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		17.13	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		17.12	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	VEGFC	P49767	419 aa		17.12	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC35B1	P78383	322 aa		17.12	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PLA2G7	Q13093	441 aa		17.12	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		17.12	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	REC114	Q7Z4M0	266 aa		17.12	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		17.12	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		17.12	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	17.12	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		17.11	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	17.11	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	SOX6	P35712	828 aa		17.11	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	CFHR3	Q02985	330 aa		17.11	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		17.11	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	SETD6	Q8TBK2	473 aa		17.11	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		17.11	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PECR	Q9BY49	303 aa		17.11	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200		Q9N2K0	584 aa		17.11	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		17.11	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		17.11	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF580	Q9UK33	172 aa		17.11	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		17.1	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	ITGB1BP1	O14713	200 aa		17.1	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	ST8SIA5	O15466	376 aa		17.1	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC6A1	P30531	599 aa		17.1	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		17.1	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	HES5	Q5TA89	166 aa		17.1	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		17.1	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX38	Q6PEX7	206 aa		17.1	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF152	Q8N8N0	203 aa		17.1	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		17.1	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		17.1	■□□□□ 0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	17.09	■□□□□ 0.33

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms