RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558936.5

RABGGTA-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-207ENST00000558936 OR10R2Q8NGX6 335 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTA-207ENST00000558936 LGALS14Q8TCE9 139 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTA-207ENST00000558936 TOMM40LQ969M1 308 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTA-207ENST00000558936 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
RABGGTA-207ENST00000558936 YPEL2Q96QA6 119 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC25A33Q9BSK2 321 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTA-207ENST00000558936 DAPK2Q9UIK4 370 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTA-207ENST00000558936 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
RABGGTA-207ENST00000558936 H3BUI4 141 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 PDCD5O14737 125 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 ST8SIA5O15466 376 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 RRP9O43818 475 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
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RABGGTA-207ENST00000558936 IGKV1-33P01594 117 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 GSTT2P0CG29 244 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 GSTT2BP0CG30 244 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 CD28P10747 220 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 PTHLHP12272 177 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
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RABGGTA-207ENST00000558936 CNTFRP26992 372 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 LSM3P62310 102 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
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RABGGTA-207ENST00000558936 IGSF11Q5DX21 431 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 TREML4Q6UXN2 200 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa10.02□□□□□ -0.81
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RABGGTA-207ENST00000558936 LYG1Q8N1E2 194 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 C5orf56Q8N8D9 126 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 Q8N9W7 124 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 OR13F1Q8NGS4 319 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 CAPSLQ8WWF8 208 aa10.02□□□□□ -0.81
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RABGGTA-207ENST00000558936 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 PRSS22Q9GZN4 317 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 JPT1Q9UK76 154 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 SSR3Q9UNL2 185 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 A0A087WXM4 84 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 SPINT2O43291 252 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 TNFAIP8O95379 198 aa10.01□□□□□ -0.81
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RABGGTA-207ENST00000558936 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 MNDAP41218 407 aa10.01□□□□□ -0.81
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RABGGTA-207ENST00000558936 RPL39P5Q59GN2 51 aa10.01□□□□□ -0.81
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RABGGTA-207ENST00000558936 TRAT1Q6PIZ9 186 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 C16orf82Q7Z2V1 217 aa10.01□□□□□ -0.81
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RABGGTA-207ENST00000558936 DTX3Q8N9I9 347 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 OR56B1Q8NGI3 324 aa10.01□□□□□ -0.81
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RABGGTA-207ENST00000558936 KCTD7Q96MP8 289 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 NABP2Q9BQ15 211 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 FUNDC2Q9BWH2 189 aa10.01□□□□□ -0.81
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RABGGTA-207ENST00000558936 TOLLIPQ9H0E2 274 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
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RABGGTA-207ENST00000558936 GNG12Q9UBI6 72 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 M0QZ24 198 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 LPLP06858 475 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 CT45A6P0DMU7 189 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 CT45A5P0DMU8 189 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 CT45A7P0DMV0 189 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 VSIG10L2P0DP72 767 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 ALDH3B2P48448 385 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 RAB7AP51149 207 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 CTF1Q16619 201 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM30BQ3MIR4 351 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 STEAP3Q658P3 488 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 OR8H3Q8N146 312 aa10□□□□□ -0.81
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RABGGTA-207ENST00000558936 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa10□□□□□ -0.81
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RABGGTA-207ENST00000558936 A0A075B6Q4 140 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 LANCL1O43813 399 aa9.99□□□□□ -0.81
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RABGGTA-207ENST00000558936 LSAMPQ13449 338 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 CDNFQ49AH0 187 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 MOB3BQ86TA1 216 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 SETD6Q8TBK2 473 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 IL1F10Q8WWZ1 152 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 GALMQ96C23 342 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 CABLES2Q9BTV7 478 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 ATG5Q9H1Y0 275 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 RAB9BQ9NP90 201 aa9.99□□□□□ -0.81
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