RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 GPR148Q8TDV2 347 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 MUL1Q969V5 352 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 SPATA25Q9BR10 227 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 TMED9Q9BVK6 235 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 TMEM138Q9NPI0 162 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 PEX16Q9Y5Y5 336 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 TNCP24821 2201 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 EI24O14681 340 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 HSPA12AO43301 675 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 JTBO76095 146 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 CD2P06729 351 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 GTF2F2P13984 249 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 PPP3R1P63098 170 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 CX3CL1P78423 397 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 SLC25A30Q5SVS4 291 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 C1orf146Q5VVC0 180 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 FAM131AQ6UXB0 335 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 NPBQ8NG41 125 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 OR52I1Q8NGK6 324 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 ERGIC3Q9Y282 383 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-227ENST00000551441 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 ANKRD34BA5PLL1 514 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 IGLV1-51P01701 117 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 FCGR1AP12314 374 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 PPP1R27Q86WC6 154 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 LYPD6Q86Y78 171 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 ELOVL1Q9BW60 279 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 CST11Q9H112 138 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 ADAM30Q9UKF2 790 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 STUB1Q9UNE7 303 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 ORC6Q9Y5N6 252 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 GMPPBQ9Y5P6 360 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 A0A1W2PPK0 400 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 SNTNA6NMZ2 147 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 ST8SIA5O15466 376 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 NDUFA3O95167 84 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 BAG2O95816 211 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 FADS2O95864 444 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 ALPLP05186 524 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 GABRB1P18505 474 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 DEFA5Q01523 94 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 ACTBL2Q562R1 376 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 RPL39P5Q59GN2 51 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 LFNGQ8NES3 379 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 RHOVQ96L33 236 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 RDH12Q96NR8 316 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 SELENOIQ9C0D9 397 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 TUBA4BQ9H853 241 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 RAB9BQ9NP90 201 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 RRHO14718 337 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 TRGV3P03979 118 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 MAS1P04201 325 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 IFNA6P05013 189 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 LIMS3P0CW19 117 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 LIMS4P0CW20 117 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 RIPK1Q13546 671 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 OR2G6Q5TZ20 316 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 JAGN1Q8N5M9 183 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 PYDC1Q8WXC3 89 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 SPACA1Q9HBV2 294 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 KCNIP1Q9NZI2 227 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 A8MZ25 164 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 ETV1P50549 477 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 TMEM30BQ3MIR4 351 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 STEAP3Q658P3 488 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 ZFP41Q8N8Y5 198 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 OR5T1Q8NG75 326 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 JPT1Q9UK76 154 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 FRAS1Q86XX4 4008 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 IZUMO1RA6ND01 250 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 H7C2Y5 167 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 CA2P00918 260 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 CT45A6P0DMU7 189 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 CT45A5P0DMU8 189 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 CT45A7P0DMV0 189 aa12.29□□□□□ -0.44
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