RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 OOSP1A8MZH6 123 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 TRDCB7Z8K6 153 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 BET1O15155 118 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 FABP7O15540 132 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 SCGNO76038 276 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 NDUFA7O95182 113 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 GSTT2P0CG29 244 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 GSTT2BP0CG30 244 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 MNDAP41218 407 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 OR3A3P47888 321 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 RAB7AP51149 207 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 ZNF137PP52743 207 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 IGSF11Q5DX21 431 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 HACD4Q5VWC8 232 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 STEAP3Q658P3 488 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 Q6ZS46 218 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 DRAM1Q8N682 238 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 OR4F5Q8NH21 305 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 LINC01006Q8NI28 216 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 CAPSLQ8WWF8 208 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-211ENST00000548041 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 HSPA12AO43301 675 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 HPGDSO60760 199 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 TMEM127O75204 238 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 TSPAN9O75954 239 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 RGS11O94810 467 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 IGKV1D-33P01593 117 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 IGKV1-33P01594 117 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 FCER2P06734 321 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 DTYMKP23919 212 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 ZBTB25P24278 435 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 IL3RAP26951 378 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 BRS3P32247 399 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 TALDO1P37837 337 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 CEACAM6P40199 344 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 RORCP51449 518 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 ARHGDIBP52566 201 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 GNG2P59768 71 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 KRTAP10-3P60369 221 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 MOB3BQ86TA1 216 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 OR8H3Q8N146 312 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 PHF21AQ96BD5 680 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 ABCG5Q9H222 651 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 ZNF702PQ9H963 129 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 RNF114Q9Y508 228 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 A0A0A6YYH2 397 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 A6NJ64 397 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 POM121CA8CG34 1229 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 H3BMQ9 156 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 TMEM11P17152 192 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 ELK1P19419 428 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 KIR2DS4P43632 304 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 TAS2R20P59543 309 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 BLCAPP62952 87 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 HES1Q14469 280 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 HNF4GQ14541 408 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 KIR2DS1Q14954 304 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 ARL6IP1Q15041 203 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 Q6ZS49 121 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-211ENST00000548041 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.8 ms