RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 TAS2R43P59537 309 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 HIST1H3AP68431 136 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 PLGLB1Q02325 96 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 GUSBP1Q15486 140 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 DGUOKQ16854 277 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 ADAM5Q6NVV9 412 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 DNM1P34Q6PK57 102 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 HIST2H3AQ71DI3 136 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 NECAP1Q8NC96 275 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 OR6F1Q8NGZ6 308 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 ABHD3Q8WU67 409 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 RNF133Q8WVZ7 376 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 ASB17Q8WXJ9 295 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 C11orf40Q8WZ69 217 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 GHSRQ92847 366 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM203Q969S6 136 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 RPEQ96AT9 228 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF75AQ96N20 296 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 RBP7Q96R05 134 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 MED18Q9BUE0 208 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 BARHL1Q9BZE3 327 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 DEFB127Q9H1M4 99 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 RBKSQ9H477 322 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 TIGARQ9NQ88 270 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 LHFPL6Q9Y693 200 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 MYO7BQ6PIF6 2116 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 ZGRF1Q86YA3 2104 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF726A6NNF4 738 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 TRDCB7Z8K6 153 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 K7EN84 100 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 GABRPO00591 440 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 PHYHO14832 338 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 PIN1P1O15428 100 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 TACSTD2P09758 323 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 COX5AP20674 150 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 OPRL1P41146 370 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 KIR3DL2P43630 455 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 LSM6P62312 80 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 OXA1LQ15070 435 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 TRAM1Q15629 374 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 PGAP1Q75T13 922 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 MTURNQ8N3F0 131 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRC-214ENST00000530727 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 OR2G2Q8NGZ5 317 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 FNDC9Q8TBE3 224 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 THEM6Q8WUY1 208 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 SLC25A46Q96AG3 418 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 FBXO17Q96EF6 278 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 TMED9Q9BVK6 235 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 TTTY10Q9BZA0 68 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 LINC00470Q9BZP3 86 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 RERGLQ9H628 205 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 KLK11Q9UBX7 282 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 GNG8Q9UK08 70 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 SSR3Q9UNL2 185 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 CFAP46Q8IYW2 2715 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 ATRXP46100 2492 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1B0GTH9 108 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM213A2RRL7 107 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 OR5B21A6NL26 309 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV4-39P01824 125 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 UCHL1P09936 223 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 PET100P0DJ07 73 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 CD37P11049 281 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF823P16415 610 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 HLA-GP17693 338 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 HLA-DMAP28067 261 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 GPR183P32249 361 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 SDC2P34741 201 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 SERPINB10P48595 397 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 OR5I1Q13606 314 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 MOGQ16653 247 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF404Q494X3 552 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ACSM3Q53FZ2 586 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 FFAR4Q5NUL3 377 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 FAM27D1Q5T7N8 215 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 FAM27BQ5VT28 67 aa3.34□□□□□ -1.88
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