RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHTF8P0CG12 524 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 C8orf88P0DMB2 117 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRKACAP17612 351 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 M6PRP20645 277 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPRR2DP22532 72 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TNFSF8P32971 234 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR3A1P47881 315 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SERPINB9P50453 376 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CRYBA2P53672 197 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 NAA20P61599 178 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBE2HP62256 183 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CNBPP62633 177 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 GRB2P62993 217 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 HTD2P86397 168 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF79Q15937 498 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 STX1AQ16623 288 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RRN3P1Q2M238 152 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 C17orf58Q2M2W7 97 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TEX30Q5JUR7 227 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACTL10Q5JWF8 245 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ENTPD8Q5MY95 495 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM162BQ5T6X4 162 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ELP2Q6IA86 826 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLET1Q6UQ28 207 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ASRGL1Q7L266 308 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SSX9Q7RTT3 188 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADCK1Q86TW2 530 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OAFQ86UD1 273 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC22A9Q8IVM8 553 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ELMOD2Q8IZ81 293 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNF148Q8N7C7 305 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM116Q8NCL8 245 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF439Q8NDP4 499 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR52N4Q8NGI2 321 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR52M1Q8NGK5 317 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR51A7Q8NH64 312 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RFESDQ8TAC1 157 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RXFP4Q8TDU9 374 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACMSDQ8TDX5 336 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPP3R2Q96LZ3 170 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR14A2Q96R54 314 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 NEU1Q99519 415 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 C1orf50Q9BV19 199 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TM2D2Q9BX73 214 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OSBPL10Q9BXB5 764 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 NUAK2Q9H093 628 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q9HAA7 133 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 AKIP1Q9NQ31 210 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC35D1Q9NTN3 355 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ABHD10Q9NUJ1 306 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZIM2Q9NZV7 527 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 GHRLQ9UBU3 117 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RABAC1Q9UI14 185 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TFR2Q9UP52 801 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 GAB2Q9UQC2 676 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 MED31Q9Y3C7 131 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNX13Q9Y5W8 968 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV27A0A087WT01 109 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A087WUU8 490 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV39A0A0B4J263 110 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CBY3A6NI87 242 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 KNCNA6PVL3 124 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSPB6O14558 160 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 LECT2O14960 151 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OGG1O15527 345 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SULT1B1O43704 296 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 LANCL1O43813 399 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PEX11AO75192 247 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RBBP9O75884 186 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR2J3O76001 311 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACTL6BO94805 426 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 DHFRP00374 187 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 NRASP01111 189 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRH1P02810 166 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CSN2P05814 226 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CD14P08571 375 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPA2P15927 270 aa1.23□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms