RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSMD7P51665 324 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IZUMO2Q6UXV1 221 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ODF3L1Q8IXM7 274 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR51D1Q8NGF3 324 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PHF21AQ96BD5 680 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GFI1Q99684 422 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LPAR5Q9H1C0 372 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLGRKTQ9HBL7 147 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSF4Q9ULV5 492 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGLL1P15814 213 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LSAMPQ13449 338 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GNMTQ14749 295 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TEX38Q6PEX7 206 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MOB1BQ7L9L4 216 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C5orf24Q7Z6I8 188 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SVOPQ8N4V2 548 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STEAP1Q9UHE8 339 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC00527Q9UJ94 153 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BLOC1S6Q9UL45 172 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAB26Q9ULW5 256 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MGAT4AQ9UM21 535 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A0A6YYD4 124 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SOCS1O15524 211 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CALRP27797 417 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAP2K4P45985 399 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 F2RL1P55085 397 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FABP5Q01469 135 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAB11BQ15907 218 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOXB2Q5VYV0 432 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR2AK2Q8NG84 335 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GHITMQ9H3K2 345 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNK15Q9H427 330 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF580Q9UK33 172 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITGB1BP1O14713 200 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RRP9O43818 475 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGF1P05019 195 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SOX6P35712 828 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYCNOSP40205 109 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 THBS3P49746 956 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 P2RY14Q15391 338 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C2orf76Q3KRA6 126 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM71F2Q6NXP2 309 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 Q6ZPA2 131 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF367Q7RTV3 350 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC00482Q8N8I6 264 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IL1F10Q8WWZ1 152 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CNBD2Q96M20 576 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NABP2Q9BQ15 211 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIPOXQ9P0Z9 390 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 V9GY05 133 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ELANEP08246 267 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM50BP56557 158 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF152Q8N8N0 203 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM3DQ96BQ1 224 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AK3Q9UIJ7 227 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDCD5O14737 125 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAB29O14966 203 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LDLRAD4O15165 306 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR3A3P47888 321 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACTBP60709 375 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOXE3Q13461 319 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MMDQ15546 238 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ETV3LQ6ZN32 361 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF695Q8IW36 515 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR56B1Q8NGI3 324 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SETD6Q8TBK2 473 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSPB9Q9BQS6 159 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF251Q9BRH9 671 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPR61Q9BZJ8 451 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IFI27L2Q9H2X8 130 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC23A1Q9UHI7 598 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERICH4A6NGS2 130 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DENRO43583 198 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGHG4P01861 327 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR5H8P0DN80 308 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VDAC1P21796 283 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GALP22466 123 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZBTB25P24278 435 aa13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms