RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513020.5

SH3BP2-224, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 868 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-224ENST00000513020 NOTOA8MTQ0 251 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 TXNL1O43396 289 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 YPEL1O60688 119 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 FBXO24O75426 580 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 RGS11O94810 467 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 TNFAIP8O95379 198 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 CD28P10747 220 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 MXD1Q05195 221 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 C2orf68Q2NKX9 166 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 ODF3L1Q8IXM7 274 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 IZUMO1Q8IYV9 350 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 RAB3CQ96E17 227 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 KCTD7Q96MP8 289 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 YPEL2Q96QA6 119 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 WNT10AQ9GZT5 417 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 DAPK2Q9UIK4 370 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 KCNK7Q9Y2U2 307 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 CMYA5Q8N3K9 4069 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 M0QZK8 103 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 RAB27BO00194 218 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 ST8SIA5O15466 376 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 CLEC2LP0C7M8 214 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 GNB3P16520 340 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 RAB6AP20340 208 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 SDC2P34741 201 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 STEAP3Q658P3 488 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 SFXN4Q6P4A7 337 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 TPRA1Q86W33 373 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 C5orf56Q8N8D9 126 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 TSPAN14Q8NG11 270 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 OR2AK2Q8NG84 335 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 OR10R2Q8NGX6 335 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 CENPOQ9BU64 300 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 MMP27Q9H306 513 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 Q9N2K0 584 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 OR1A1Q9P1Q5 309 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 SLC23A1Q9UHI7 598 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 A0A087WXM4 84 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 METTL21EPA6NDL7 271 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 MFNGO00587 321 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 FGF16O43320 207 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 CSF1P09603 554 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 SCTP09683 121 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 CD3GP09693 182 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 CD1BP29016 333 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 OR3A3P47888 321 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 EBI3Q14213 229 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 LY6G6FQ5SQ64 297 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 Q8N6K4 173 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 OR2T10Q8NGZ9 312 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 LGALS14Q8TCE9 139 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 PTX4Q96A99 478 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 ATG5Q9H1Y0 275 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 IFI27L2Q9H2X8 130 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 MGAT4AQ9UM21 535 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 HSPA12AO43301 675 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 LANCL1O43813 399 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 MOSP00540 346 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 FCGR3AP08637 254 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 ZBTB25P24278 435 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 TGFBR1P36897 503 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 CEACAM6P40199 344 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 LSAMPQ13449 338 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 C10orf99Q6UWK7 81 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 OR5AU1Q8NGC0 362 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 MAFIPQ8WZ33 124 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 ABHD14BQ96IU4 210 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 VCX3AQ9NNX9 186 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 TRDCB7Z8K6 153 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 F2RL1P55085 397 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 ARFRP1Q13795 201 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 RPL39P5Q59GN2 51 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 IDNKQ5T6J7 187 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 Q8N9W7 124 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 NABP2Q9BQ15 211 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 PIPOXQ9P0Z9 390 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 LINC00527Q9UJ94 153 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms