RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498694.1

CTPS1-212, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 599 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-212ENST00000498694 FOXH1O75593 365 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 TPPPO94811 219 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 DIRAS3O95661 229 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 LY6G6DO95868 133 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 HEXAP06865 529 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 CGB3P0DN86 165 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 CGB7P0DN87 165 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 GNB3P16520 340 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 CCL3L1P16619 93 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 ELK1P19419 428 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 GLIPR1P48060 266 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 VEGFCP49767 419 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 RPL31P62899 125 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 LCN2P80188 198 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 EDDM3AQ14507 147 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 HERPUD1Q15011 391 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 ARL6IP1Q15041 203 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 TMEM30BQ3MIR4 351 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 C9orf152Q5JTZ5 239 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 KRBOX4Q5JUW0 171 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 TMEM69Q5SWH9 247 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 ATAD3CQ5T2N8 411 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 SLC35E4Q6ICL7 350 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 ACSM6Q6P461 480 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 CNIH2Q6PI25 160 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 Q6ZNX1 250 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 Q6ZS49 121 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 LINC00299Q6ZSB3 139 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 Q6ZTK2 550 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 BTN2A1Q7KYR7 527 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 GLCCI1Q86VQ1 547 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 C11orf42Q8N5U0 333 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 Q8N7P7 452 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 OR13A1Q8NGR1 328 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 MCFD2Q8NI22 146 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 SMIM4Q8WVI0 70 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 CORO2AQ92828 525 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 SNAPC3Q92966 411 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 RAB3CQ96E17 227 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 NEDD4LQ96PU5 975 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 ABHD1Q96SE0 405 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 SOSTQ9BQB4 213 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 SRRQ9GZT4 340 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 MMP27Q9H306 513 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 LINC00574Q9H8X3 128 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 CALYQ9NYX4 217 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 COMMD3Q9UBI1 195 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 EXTL2Q9UBQ6 330 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 HSPB7Q9UBY9 170 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 GLS2Q9UI32 602 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 KIF25Q9UIL4 384 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 INSIG2Q9Y5U4 225 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 PEX16Q9Y5Y5 336 aa3.3□□□□□ -1.88
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CTPS1-212ENST00000498694 FBN3Q75N90 2809 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 LOC105371242A0A075B767 164 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 MEIKINA0A087WXM9 373 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 TRAV40A0A0B4J280 105 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 A0A0G2JMP0 313 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 A0A0X1KG70 313 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 hADV38S2A0JD32 116 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 METTL21EPA6NDL7 271 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 NPIPB5A8MRT5 1133 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 C17orf98A8MV24 154 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 ODF3BA8MYP8 253 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 C12orf77C9JDV5 145 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 MCRIP1C9JLW8 97 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 J3QLI3 93 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 CTDSP2O14595 271 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 RGS5O15539 181 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 MMP23AO75900 390 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 ECDO95905 644 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 HLA-DQB1P01920 261 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 LIPFP07098 398 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 PPIAL4GP0DN37 164 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 PTHLHP12272 177 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 NDUFB7P17568 137 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 CD34P28906 385 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 EDDM3BP56851 147 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 AESQ08117 197 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 FOXI1Q12951 378 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 KLRD1Q13241 179 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 C6orf183Q5T699 404 aa3.29□□□□□ -1.88
CTPS1-212ENST00000498694 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa3.29□□□□□ -1.88
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