RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	ESD	P10768	282 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	ALOX5AP	P20292	161 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	PSMB3	P49720	205 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	OR4D1	Q15615	310 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	XKRX	Q6PP77	449 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	OR4X1	Q8NH49	305 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	TMEM56	Q96MV1	263 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	MND1	Q9BWT6	205 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	C16orf95	Q9H693	158 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	SNX12	Q9UMY4	172 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		0.91	□□□□□ -2.26
USP34-222	ENST00000498268	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	DHRS12	A0PJE2	317 aa		0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268		M0QYV0	167 aa		0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	PHYH	O14832	338 aa		0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	STK16	O75716	305 aa		0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	ADORA1	P30542	326 aa		0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	RAB8A	P61006	207 aa		0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	RORB	Q92753	470 aa		0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	FAM210A	Q96ND0	272 aa		0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	UPK3B	Q9BT76	320 aa		0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	PECR	Q9BY49	303 aa		0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	GLS2	Q9UI32	602 aa		0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		0.9	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	COL4A2	P08572	1712 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	ZNF879	B4DU55	563 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268		H3BPC8	53 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268		J3QQQ9	107 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	ZW10	O43264	779 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	MPZL2	O60487	215 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	UGT2B11	O75310	529 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	ARL6IP5	O75915	188 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	GPX1	P07203	203 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	ATP6V0C	P27449	155 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	OR1E2	P47887	323 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	KCNJ3	P48549	501 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	ETV1	P50549	477 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	FAM3A	P98173	230 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	XRCC4	Q13426	336 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	FGF13	Q92913	245 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	TAMM41	Q96BW9	452 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	MED28	Q9H204	178 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	NCKAP5	O14513	1909 aa		0.89	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		0.88	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	C11orf86	A6NJI1	115 aa		0.88	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268		F5H5K5	113 aa		0.88	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	GP1BA	P07359	652 aa		0.88	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	OR13C7	P0DN81	318 aa		0.88	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	CRHBP	P24387	322 aa		0.88	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	CDK2	P24941	298 aa		0.88	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	DLX6	P56179	175 aa		0.88	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	ANGPT1	Q15389	498 aa		0.88	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	SYCP1	Q15431	976 aa		0.88	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		0.88	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268		Q6ZSA8	131 aa		0.88	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	SLC35F6	Q8N357	371 aa		0.88	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		0.88	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		0.88	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	TMBIM1	Q969X1	311 aa		0.88	□□□□□ -2.27
USP34-222	ENST00000498268	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		0.88	□□□□□ -2.27

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