RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 PBOV1Q9GZY1 135 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 HHLA2Q9UM44 414 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 MEMO1Q9Y316 297 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF320A2RRD8 509 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 M0R135 149 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 CCL1P22362 96 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV1-2P23083 117 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 OPRM1P35372 400 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 RND2P52198 227 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXF2Q12947 444 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 Q6ZSR3 168 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM222BQ8WU58 562 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF799Q96GE5 643 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 AQP10Q96PS8 301 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF391Q9UJN7 358 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB22AQ9UL26 194 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 E9PLN8 166 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 MSTNO14793 375 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 IGLV3-1P01715 115 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 TTRP02766 147 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 FSTP19883 344 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 LGALS7P47929 136 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 TAS2R20P59543 309 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 PLP2Q04941 152 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 GABRA6Q16445 453 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR146Q96CH1 333 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 HAVCR1Q96D42 359 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 NMES1Q9C002 83 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 CHST6Q9GZX3 395 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 DHDHQ9UQ10 334 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ETV7Q9Y603 341 aa6.19□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 CACNA1CQ13936 2221 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF727A8MUV8 499 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 CALCBP10092 127 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 TNFSF4P23510 183 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 PMS2P11Q13670 270 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 MIDNQ504T8 468 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 C9orf135Q5VTT2 229 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 DOK3Q7L591 496 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 STPG4Q8N801 248 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4X1Q8NH49 305 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 GPX8Q8TED1 209 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 TVP23CQ96ET8 276 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 SEC22AQ96IW7 307 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 TBX15Q96SF7 602 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ATP6V0BQ99437 205 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10A2Q9H208 303 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 NOX4Q9NPH5 578 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 IGF2RP11717 2491 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 FRYQ5TBA9 3013 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A096LPE4 126 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PPZ6 126 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 F5H5K5 113 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 H3BQ15 152 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 PIN1P1O15428 100 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 LIPFP07098 398 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 CD37P11049 281 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 TUBG1P23258 451 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 CA7P43166 264 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB11AP62491 216 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM3AP98173 230 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 DHRS2Q13268 280 aa6.18□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 C4orf17Q53FE4 359 aa6.18□□□□□ -1.42
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