RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290		H3BUX3	64 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC31A2	O15432	143 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	GNG10	P50151	68 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB7A	P51149	207 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	TAS2R20	P59543	309 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	GNG2	P59768	71 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	OR8H3	Q8N146	312 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	GHITM	Q9H3K2	345 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	TCF19	Q9Y242	345 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HCLS1-208	ENST00000487290	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	BTBD17	A6NE02	478 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	TXNL1	O43396	289 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	ELK1	P19419	428 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	ZBTB25	P24278	435 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	IL3RA	P26951	378 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	TALDO1	P37837	337 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	CBX5	P45973	191 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	SETD6	Q8TBK2	473 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	CFHR4	Q92496	578 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290		A6NDX4	124 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	HSD17B6	O14756	317 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	LANCL1	O43813	399 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	GPR137B	O60478	399 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	HPGDS	O60760	199 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV3-7	P01780	117 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	HLA-DQB1	P01920	261 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	PAX6	P26367	422 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	ARHGDIB	P52566	201 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	HOGA1	Q86XE5	327 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	TOMM40L	Q969M1	308 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	RPE	Q96AT9	228 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	DUX5	Q96PT3	197 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A1W2PPE3	182 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM89	A2RUT3	159 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	NDUFA7	O95182	113 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	GSTT2	P0CG29	244 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	GSTT2B	P0CG30	244 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	HKR1	P10072	659 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	NAT1	P18440	290 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	EBI3	Q14213	229 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	CNIH2	Q6PI25	160 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB18	Q9NP72	206 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	SULT1C2	O00338	296 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	CTXN2	P0C2S0	81 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	BRS3	P32247	399 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	IGSF11	Q5DX21	431 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	GPX8	Q8TED1	209 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	SNAPC3	Q92966	411 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	MDFI	Q99750	246 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	GAB2	Q9UQC2	676 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	TIMM23	O14925	209 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	LPL	P06858	475 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	LAX1	Q8IWV1	398 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	BEST4	Q8NFU0	473 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HCLS1-208	ENST00000487290	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28

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