RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484874.2

CNKSR1-208, Transcript of connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

TSL 3

Gene CNKSR1, Length 642 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1-208ENST00000484874 XRCC3O43542 346 aa14.55□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 ZBTB25P24278 435 aa14.55□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 UBE2NLQ5JXB2 153 aa14.55□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 DTX3Q8N9I9 347 aa14.55□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 IL1F10Q8WWZ1 152 aa14.55□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 TOMM40LQ969M1 308 aa14.55□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 MMP24Q9Y5R2 645 aa14.55□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 TRAV18A0A075B6X5 111 aa14.54□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 SLC31A2O15432 143 aa14.54□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 TSPAN9O75954 239 aa14.54□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 GNMTQ14749 295 aa14.54□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 LY6EQ16553 131 aa14.54□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 PLA1AQ53H76 456 aa14.54□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 SAMD12Q8N8I0 201 aa14.54□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 FABP7O15540 132 aa14.53□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 APOA1P02647 267 aa14.53□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 LPLP06858 475 aa14.53□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 FAM106CPP0CH98 169 aa14.53□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 CEACAM6P40199 344 aa14.53□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 RELBQ01201 579 aa14.53□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa14.53□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 MZT2AQ6P582 158 aa14.53□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 C16orf82Q7Z2V1 217 aa14.53□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 OR4F5Q8NH21 305 aa14.53□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 AP3S1Q92572 193 aa14.53□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa14.53□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 C16orf95Q9H693 158 aa14.53□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 AUNIPQ9H7T9 357 aa14.53□□□□□ -0.08
CNKSR1-208ENST00000484874 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 A0A1W2PPI3 338 aa14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 TMEM235A6NFC5 223 aa14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 HSD17B6O14756 317 aa14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 HSPA12AO43301 675 aa14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 TXNL1O43396 289 aa14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 LANCL1O43813 399 aa14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 GSTT2P0CG29 244 aa14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 GSTT2BP0CG30 244 aa14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 GNG2P59768 71 aa14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 AWAT1Q58HT5 328 aa14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 ODF3L1Q8IXM7 274 aa14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 OR2AK2Q8NG84 335 aa14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 CFHR4Q92496 578 aa14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 BEX1Q9HBH7 125 aa14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 COMMD3Q9UBI1 195 aa14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa14.51□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 TIMM23O14925 209 aa14.51□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 SSX5O60225 188 aa14.51□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 CTXN2P0C2S0 81 aa14.51□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 RAG2P55895 527 aa14.51□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 EBI3Q14213 229 aa14.51□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 HERPUD1Q15011 391 aa14.51□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.51□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 Q6ZSV7 163 aa14.51□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 LYG1Q8N1E2 194 aa14.51□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 AGMATQ9BSE5 352 aa14.51□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa14.51□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.51□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 RAB29O14966 203 aa14.5□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 CHST1O43916 411 aa14.5□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 CD1BP29016 333 aa14.5□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 SOX6P35712 828 aa14.5□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 SPCS2Q15005 226 aa14.5□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 FAM71F2Q6NXP2 309 aa14.5□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.5□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 DRAM1Q8N682 238 aa14.5□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.5□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa14.5□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 AKR1E2Q96JD6 320 aa14.5□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 OR1A1Q9P1Q5 309 aa14.5□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 CEPT1Q9Y6K0 416 aa14.5□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 CLPSL1A2RUU4 121 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 OR2F2O95006 317 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 CBX5P45973 191 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 IGSF11Q5DX21 431 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 CNIH2Q6PI25 160 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 MOB3BQ86TA1 216 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 TMEM219Q86XT9 240 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 IZUMO1Q8IYV9 350 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 LINC01006Q8NI28 216 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-208ENST00000484874 ISOC1Q96CN7 298 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms