RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484412.1

HDLBP-240, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 669 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-240	ENST00000484412	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	RPE	Q96AT9	228 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412		A0A1W2PPI3	338 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412		M0QZK8	103 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	OR2F2	O95006	317 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	FCGR3A	P08637	254 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	TGFBR1	P36897	503 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	VBP1	P61758	197 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	ACTG1	P63261	375 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	LEAP2	Q969E1	77 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	SMIM30	A4D0T7	59 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	FGF16	O43320	207 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	APOA1	P02647	267 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	CEACAM6	P40199	344 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	RAG2	P55895	527 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	PROK1	P58294	105 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	TOMM40L	Q969M1	308 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	PHF21A	Q96BD5	680 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	FAM172BP	A6NC97	362 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	HSD17B6	O14756	317 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	RAB29	O14966	203 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	SLC31A2	O15432	143 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	FABP7	O15540	132 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	PAX6	P26367	422 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	TALDO1	P37837	337 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	ARFRP1	Q13795	201 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	HERPUD1	Q15011	391 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	LTC4S	Q16873	150 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	PRR18	Q8N4B5	295 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412		Q8N6K4	173 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	RNF5	Q99942	180 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	CHST1	O43916	411 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	PROP1	O75360	226 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	IGHV3-7	P01780	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	GSTT2	P0CG29	244 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	GSTT2B	P0CG30	244 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	CBX5	P45973	191 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	MZT2A	Q6P582	158 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	CNIH2	Q6PI25	160 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	HOGA1	Q86XE5	327 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	UBALD1	Q8TB05	177 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	AP3S1	Q92572	193 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412		A0A1W2PPE3	182 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	TIMM23	O14925	209 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	SSX5	O60225	188 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	HLA-DQB1	P01920	261 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	AMY1A	P04745	511 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	AMY2A	P04746	511 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	NAT1	P18440	290 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	MC5R	P33032	325 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	GNG10	P50151	68 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	GNMT	Q14749	295 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	LY6E	Q16553	131 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	DRAM1	Q8N682	238 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	SETD6	Q8TBK2	473 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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