RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 PIPOXQ9P0Z9 390 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 A0A1W2PPE3 182 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 RAB27BO00194 218 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 RAB29O14966 203 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 KCNAB3O43448 404 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 VSIG10L2P0DP72 767 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 CD24P25063 80 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 ZNF134P52741 427 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 BLCAPP62952 87 aa10.66□□□□□ -0.7
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PRAME-211ENST00000476336 LYG1Q8N1E2 194 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 KLHDC1Q8N7A1 406 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 OR10V1Q8NGI7 309 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 UBALD1Q8TB05 177 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 S1PR3Q99500 378 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 OR51E2Q9H255 320 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 Q9N2K0 584 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP10.66□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 ETV7Q9Y603 341 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa10.65□□□□□ -0.7
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PRAME-211ENST00000476336 MOSP00540 346 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 IGKV1D-33P01593 117 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 IGKV1-33P01594 117 aa10.65□□□□□ -0.7
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PRAME-211ENST00000476336 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 HLA-DRB3P79483 266 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 ABCA11PQ4W5N1 156 aa10.65□□□□□ -0.7
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PRAME-211ENST00000476336 OR4A4PQ8NGN8 299 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 WNT10AQ9GZT5 417 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-211ENST00000476336 ATG5Q9H1Y0 275 aa10.65□□□□□ -0.7
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PRAME-211ENST00000476336 A0A0A6YYH2 397 aa10.64□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 A6NJ64 397 aa10.64□□□□□ -0.71
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PRAME-211ENST00000476336 FBXO24O75426 580 aa10.64□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 TALDO1P37837 337 aa10.64□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa10.64□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 Q6ZS49 121 aa10.64□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 NR2C2APQ86WQ0 139 aa10.64□□□□□ -0.71
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PRAME-211ENST00000476336 SIGLEC9Q9Y336 463 aa10.64□□□□□ -0.71
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PRAME-211ENST00000476336 SLC31A2O15432 143 aa10.63□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 AIREO43918 545 aa10.63□□□□□ -0.71
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PRAME-211ENST00000476336 CEACAM6P40199 344 aa10.63□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 REG1BP48304 166 aa10.63□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP10-3P60369 221 aa10.63□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 ARFRP1Q13795 201 aa10.63□□□□□ -0.71
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PRAME-211ENST00000476336 C5orf56Q8N8D9 126 aa10.63□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 DCSTAMPQ9H295 470 aa10.63□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 KCNK7Q9Y2U2 307 aa10.63□□□□□ -0.71
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PRAME-211ENST00000476336 FABP7O15540 132 aa10.62□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 OPN1MWP04001 364 aa10.62□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 AMY1AP04745 511 aa10.62□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 AMY2AP04746 511 aa10.62□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 FCGR3AP08637 254 aa10.62□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 CTXN2P0C2S0 81 aa10.62□□□□□ -0.71
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PRAME-211ENST00000476336 OPN1MW3P0DN78 364 aa10.62□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 GNB3P16520 340 aa10.62□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 GNMTQ14749 295 aa10.62□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa10.62□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 NDUFA11Q86Y39 141 aa10.62□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 FOXRED2Q8IWF2 684 aa10.62□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 Q8N6K4 173 aa10.62□□□□□ -0.71
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PRAME-211ENST00000476336 OR10J5Q8NHC4 309 aa10.62□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 CHPT1Q8WUD6 406 aa10.62□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 TOLLIPQ9H0E2 274 aa10.62□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 ZNF221Q9UK13 617 aa10.62□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa10.61□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 OR5H14A6NHG9 310 aa10.61□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 IGHG2P01859 326 aa10.61□□□□□ -0.71
PRAME-211ENST00000476336 SCTP09683 121 aa10.61□□□□□ -0.71
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