RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 CAPSLQ8WWF8 208 aa13.14□□□□□ -0.31
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ATG4B-216ENST00000475195 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
ATG4B-216ENST00000475195 VCX3AQ9NNX9 186 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG4B-216ENST00000475195 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.31
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ATG4B-216ENST00000475195 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
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ATG4B-216ENST00000475195 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
ATG4B-216ENST00000475195 RHBDL2Q9NX52 303 aa13.08□□□□□ -0.32
ATG4B-216ENST00000475195 OR1A1Q9P1Q5 309 aa13.08□□□□□ -0.32
ATG4B-216ENST00000475195 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
ATG4B-216ENST00000475195 SPATA2Q9UM82 520 aa13.08□□□□□ -0.32
ATG4B-216ENST00000475195 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa13.07□□□□□ -0.32
ATG4B-216ENST00000475195 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa13.07□□□□□ -0.32
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