RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469403.1

AGRN-205, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 3

Gene AGRN, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-205ENST00000469403 MMP28Q9H239 520 aa21.5■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 TAS2R8Q9NYW2 309 aa21.5■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa21.5■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 FCER2P06734 321 aa21.49■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 SAA4P35542 130 aa21.49■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 ZNF134P52741 427 aa21.49■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 ACTBL2Q562R1 376 aa21.49■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 CT45A1Q5HYN5 189 aa21.49■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa21.49■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 BRD3OSQ6XYD6 125 aa21.49■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 OVCH2Q7RTZ1 564 aa21.49■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 TMEM229BQ8NBD8 167 aa21.49■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 CT45A3Q8NHU0 189 aa21.49■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 TRIM63Q969Q1 353 aa21.49■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 CREB3L1Q96BA8 519 aa21.49■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 RDH8Q9NYR8 311 aa21.49■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 ZNF69Q9UC07 566 aa21.49■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 IGHV3-7P01780 117 aa21.48■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 OR3A3P47888 321 aa21.48■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 GNG10P50151 68 aa21.48■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 OR5H2Q8NGV7 314 aa21.48■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 AJUBAQ96IF1 538 aa21.48■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 GINS4Q9BRT9 223 aa21.48■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 LY6LH3BQJ8 138 aa21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 LANCL1O43813 399 aa21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 CRLF1O75462 422 aa21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 TUSC2O75896 110 aa21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 CD74P04233 296 aa21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 CSF1P09603 554 aa21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 OR5H8P0DN80 308 aa21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 HLA-DMAP28067 261 aa21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 HTR1DP28221 377 aa21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 LGALS4P56470 323 aa21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 TAS2R19P59542 299 aa21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 SCGB2A2Q13296 93 aa21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 DYRK1AQ13627 763 aa21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 VAX1Q5SQQ9 334 aa21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 OR2AK2Q8NG84 335 aa21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 GHITMQ9H3K2 345 aa21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 FN1P02751 2386 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 MXRA5Q9NR99 2828 aa21.47■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 A0A1W2PRD5 423 aa21.46■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 A0A1W2PRF3 423 aa21.46■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 A0A1W2PRM7 423 aa21.46■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 SLC31A2O15432 143 aa21.46■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 EPHA1P21709 976 aa21.46■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 HRH1P35367 487 aa21.46■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 RAB7AP51149 207 aa21.46■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 ZNF137PP52743 207 aa21.46■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa21.46■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 AGMATQ9BSE5 352 aa21.46■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 DPM3Q9P2X0 92 aa21.46■■□□□ 1.03
AGRN-205ENST00000469403 A0A1W2PPE3 182 aa21.45■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa21.45■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 SRD5A1P18405 259 aa21.45■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 RFX2P48378 723 aa21.45■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 DHRS11Q6UWP2 260 aa21.45■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 GIMAP1Q8WWP7 306 aa21.45■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 MALSU1Q96EH3 234 aa21.45■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 IFI27L2Q9H2X8 130 aa21.45■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 EHFQ9NZC4 300 aa21.45■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 ZNRD1Q9P1U0 126 aa21.45■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 LEUTXA8MZ59 168 aa21.44■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 PMP2P02689 132 aa21.44■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 CD3DP04234 171 aa21.44■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 CEACAM3P40198 252 aa21.44■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa21.44■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 OR10X1Q8NGY0 326 aa21.44■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa21.44■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 PRDM13Q9H4Q3 707 aa21.44■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 OR2W1Q9Y3N9 320 aa21.44■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 A0A0U1RQK1 487 aa21.43■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 OOSP1A8MZH6 123 aa21.43■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 IL3RAP26951 378 aa21.43■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 CD40LGP29965 261 aa21.43■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 PPP5CP53041 499 aa21.43■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 LSAMPQ13449 338 aa21.43■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 STEAP1BQ6NZ63 245 aa21.43■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 DEDD2Q8WXF8 326 aa21.43■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 FAM157CP0CG43 387 aa21.42■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 FCGR2CP31995 323 aa21.42■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 ZNF846Q147U1 533 aa21.42■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 BAK1Q16611 211 aa21.42■■□□□ 1.02
AGRN-205ENST00000469403 ODF3L1Q8IXM7 274 aa21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms