RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 PAXXQ9BUH6 204 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 A0A0U1RQV5 110 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 MFSD2BA6NFX1 497 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 UCNP55089 124 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 ERVFRD-1P60508 538 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 FGF12P61328 243 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 CFHR5Q9BXR6 569 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 PRR33A8MZF0 331 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 AP4M1O00189 453 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 MGST3O14880 152 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 SMPD2O60906 423 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 MRGPRGQ86SM5 289 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 PDE6DO43924 150 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 FGF5P12034 268 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 OR5AC2Q9NZP5 309 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 IL17BQ9UHF5 180 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 SP9P0CG40 484 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 COX6B1P14854 86 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 KRTCAP3Q53RY4 240 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 SPANXN1Q5VSR9 72 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 RSG1Q9BU20 258 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 KCNE5Q9UJ90 142 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 A0A1W2PQM1 296 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 PF4V1P10720 104 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 POM121Q96HA1 1249 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 KCNK17Q96T54 332 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 SRXN1Q9BYN0 137 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 ROM1Q03395 351 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 CEBPEQ15744 281 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 C19orf48Q6RUI8 117 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 RP1P56715 2156 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 FOCADQ5VW36 1801 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 OR10J1P30954 320 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 MPV17P39210 176 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 ERGP11308 486 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 DDA1Q9BW61 102 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 IL36RNQ9UBH0 155 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 CEACAM18A8MTB9 384 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 P2RY6Q15077 328 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 GBGT1Q8N5D6 347 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 ADIPOR1Q96A54 375 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 C5orf52A6NGY3 159 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 IGKV3-15P01624 115 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 APCSP02743 223 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 APC2O95996 2303 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 SFTPCP11686 197 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 TMPRSS3P57727 454 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 GUCA2BQ16661 112 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 AHRRA9YTQ3 701 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 HYPMO75409 117 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 COX6A1P12074 109 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 GHITMQ9H3K2 345 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 LAMB2P55268 1798 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 DHRS7CA6NNS2 312 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 ZIC3O60481 467 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 MMP9P14780 707 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM191AQ9H0A3 160 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 ADAM11O75078 769 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 TIAF1O95411 115 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 ID1P41134 155 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 STARD6P59095 220 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 RTN4RQ9BZR6 473 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 SIRT7Q9NRC8 400 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 TNFSF18Q9UNG2 199 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 LHFPL6Q9Y693 200 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 CDK2AP1O14519 115 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 PGA5P0DJD9 388 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 IFT22Q9H7X7 185 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 PITX3O75364 302 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRF-209ENST00000438120 TWIST1Q15672 202 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms