RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 LRP5LA4QPB2 252 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 ALG1L2C9J202 215 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 H0Y8G0 127 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 MPPED1O15442 326 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 TIAF1O95411 115 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 CA7P43166 264 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 CKS1BP61024 79 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM215Q68D42 235 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 FAM71F2Q6NXP2 309 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 OR5B3Q8NH48 314 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 LIPHQ8WWY8 451 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 NEUROG1Q92886 237 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 EMC6Q9BV81 110 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 TAAR3PQ9P1P4 343 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 DNAH14Q0VDD8 3507 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 SNAI2O43623 268 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 EFEMP2O95967 443 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 CA2P00918 260 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 APOA2P02652 100 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 CELA3BP08861 270 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 NTSR1P30989 418 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 CLDN15P56746 228 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 ZP4Q12836 540 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 PNKDQ8N490 385 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 SOCS4Q8WXH5 440 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 S1PR5Q9H228 398 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 A0A1W2PRU2 124 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 A0A1W2PS18 150 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 S1PR2O95136 353 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 IGKV1D-33P01593 117 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 IGKV1-33P01594 117 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 TCL1AP56279 114 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 FOXL2P58012 376 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF141Q15928 474 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 LRRC3BQ96PB8 259 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 FAM206AQ9NX38 181 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 MED29Q9NX70 200 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 RARRES3Q9UL19 164 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 A6NJY4 79 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 NPIPA5E9PKD4 350 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 PPIAL4DF5H284 164 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 NPIPA3F8WFD2 350 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 H0YIG0 161 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 SRIP30626 198 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 PRSS12P56730 875 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 BCORP1Q8N888 145 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 NUDT22Q9BRQ3 303 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 CHODLQ9H9P2 273 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 CD207Q9UJ71 328 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 NPIPA1Q9UND3 350 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 CCL26Q9Y258 94 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 C2orf72A6NCS6 295 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 C8AP07357 584 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 CEBPBP17676 345 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 PGCP20142 388 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 ANOS1P23352 680 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 SEC13P55735 322 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 ARL16Q0P5N6 197 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 SLAQ13239 276 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 SLC39A11Q8N1S5 342 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 KCNS1Q96KK3 526 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 MMP17Q9ULZ9 603 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 A0A087X0K7 114 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 WISP1O95388 367 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 PPIAL4GP0DN37 164 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 NPPCP23582 126 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 ATP5G3P48201 142 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 RAB30Q15771 203 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 LRTM2Q8N967 370 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 OR2M7Q8NG81 312 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF721Q8TF20 911 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-203ENST00000395211 OR4C12Q96R67 309 aa8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms