RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356183.8

GTF3C1-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C1, Length 7,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-201ENST00000356183 PLAUP00749 431 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 CA1P00915 261 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 TMEM91Q6ZNR0 172 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 PRSS27Q9BQR3 290 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 GPR35Q9HC97 309 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 SNAI2O43623 268 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 CDS2O95674 445 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 C2orf83Q53S99 150 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 C16orf92Q96LL3 132 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF576Q9H609 170 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 INSIG2Q9Y5U4 225 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 CT62P0C5K7 136 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 GPR3P46089 330 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 NHLRC3Q5JS37 347 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 LINC00470Q9BZP3 86 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 ZFP64Q9NPA5 681 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 BCORQ6W2J9 1755 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 J3QR06 171 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 CDIPTO14735 213 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 NKX2-2O95096 273 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 VDAC1P21796 283 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 SH3BGRL3Q9H299 93 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 TMEM160Q9NX00 188 aa9.64□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 GZMMP51124 257 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 RIPPLY3P57055 190 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 YBX1P67809 324 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 COL10A1Q03692 680 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 VSTM2LQ96N03 204 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 MCM3APO60318 1980 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 STAG3L3P0CL85 134 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 NUBP1P53384 320 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 H0YL77 283 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 CCR5P51681 352 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 CACNG7P62955 275 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 C10orf111Q8N326 155 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 OR4D11Q8NGI4 311 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 WNT10AQ9GZT5 417 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 RNF122Q9H9V4 155 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 HLA-DRB1P01911 266 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 SSTR5P35346 364 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 RBKSQ9H477 322 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 SSC5DA1L4H1 1573 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 OR4C45A6NMZ5 311 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 A8MWL6 223 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 SPINK14Q6IE38 97 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 OR11H4Q8NGC9 324 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 RAB1BQ9H0U4 201 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 HSPB7Q9UBY9 170 aa9.63□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 SYNGR1O43759 233 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 TRGC1P0CF51 173 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 RRN3P1Q2M238 152 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 TMEM108Q6UXF1 575 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 DPH3Q96FX2 82 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 TCFL5Q9UL49 500 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 CCL27Q9Y4X3 112 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 HLA-DQB1P01920 261 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 NAAAQ02083 359 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 DEFB123Q8N688 67 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 HKR1P10072 659 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 LOXL3P58215 753 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 OR4D5Q8NGN0 318 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 C14orf144Q96I85 54 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 CEACAM18A8MTB9 384 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 MKRN2OSH3BPM6 223 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 C1QL1O75973 258 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 DNAL4O96015 105 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 DEGS2Q6QHC5 323 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 CADM4Q8NFZ8 388 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 ASB5Q8WWX0 329 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 COL18A1P39060 1754 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 FCGR3AP08637 254 aa9.62□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa9.61□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 PGLYRP3Q96LB9 341 aa9.61□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 DERL1Q9BUN8 251 aa9.61□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 KCNK7Q9Y2U2 307 aa9.61□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 MPC1Q9Y5U8 109 aa9.61□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
GTF3C1-201ENST00000356183 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms