RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABRACLQ9P1F3 81 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB22AQ9UL26 194 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 TXNL1O43396 289 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSF1P09603 554 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEDD8Q15843 81 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 MOGAT2Q3SYC2 334 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 LY6G6FQ5SQ64 297 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 ODF3L1Q8IXM7 274 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 LYG1Q8N1E2 194 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL1F10Q8WWZ1 152 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 C12orf4Q9NQ89 552 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOTCH1P46531 2555 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGF16O43320 207 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 LANCL1O43813 399 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGS11O94810 467 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 HLA-DRB3P79483 266 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 C9orf152Q5JTZ5 239 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR51E2Q9H255 320 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFI27L2Q9H2X8 130 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNK7Q9Y2U2 307 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB6AP20340 208 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD1BP29016 333 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2T10Q8NGZ9 312 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q9N2K0 584 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 SSR3Q9UNL2 185 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOTOA8MTQ0 251 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB27BO00194 218 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 LSAMPQ13449 338 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2AK2Q8NG84 335 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5AU1Q8NGC0 362 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10R2Q8NGX6 335 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB3CQ96E17 227 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 MGAT4AQ9UM21 535 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 MFNGO00587 321 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 MOSP00540 346 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 GADD45AP24522 165 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR3A3P47888 321 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 C10orf99Q6UWK7 81 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPRA1Q86W33 373 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFA11Q86Y39 141 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTX4Q96A99 478 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF167Q9H6Y7 350 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR1A1Q9P1Q5 309 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 ST8SIA5O15466 376 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCTP09683 121 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD36P16671 472 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q8N9W7 124 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCTD7Q96MP8 289 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLSCR3Q9NRY6 295 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC23A1Q9UHI7 598 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD3GP09693 182 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNB3P16520 340 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 SDC2P34741 201 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD83Q01151 205 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 SFXN4Q6P4A7 337 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 NABP2Q9BQ15 211 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A075B6Q4 140 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 METTL21EPA6NDL7 271 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITGB1BP1O14713 200 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHG2P01859 326 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 FCGR3AP08637 254 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLEC2LP0C7M8 214 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM71F2Q6NXP2 309 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 S1PR3Q99500 378 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF251Q9BRH9 671 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 CENPOQ9BU64 300 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 DAPK2Q9UIK4 370 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRDCB7Z8K6 153 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFAIP8O95379 198 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBTB25P24278 435 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 MXD1Q05195 221 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL39P5Q59GN2 51 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC35E3Q7Z769 313 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR8H1Q8NGG4 311 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 LGALS14Q8TCE9 139 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms