RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A26Q70HW3 274 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 MOB1BQ7L9L4 216 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF695Q8IW36 515 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXRED2Q8IWF2 684 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 Q8IYB0 196 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 CMTM1Q8IZ96 169 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF611Q8N823 705 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 OR56B2PQ8NGI1 322 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ABHD3Q8WU67 409 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 IL22RA2Q969J5 263 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf159Q96HA4 380 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PBDC1Q9BVG4 233 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 CHODLQ9H9P2 273 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC2A9Q9NRM0 540 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXL17Q9UF56 701 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 KPTNQ9Y664 436 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 C5orf49A4QMS7 147 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF732B4DXR9 585 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TRDCB7Z8K6 153 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM77I1YAP6 450 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 WRBO00258 174 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 MPPED1O15442 326 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PPYP01298 95 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 THBDP07204 575 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SOD3P08294 240 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5AC1P0C628 307 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SELEP16581 610 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 CTRB1P17538 263 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 CCNOP22674 350 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 AADACP22760 399 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 MDH2P40926 338 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 CLDN18P56856 261 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM33P57088 247 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB1AP62820 205 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF266Q14584 549 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SPIN3Q5JUX0 258 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 C10orf91Q5T1B1 145 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 CTRB2Q6GPI1 263 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ALKBH2Q6NS38 261 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 RTN4RL2Q86UN3 420 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PLPPR2Q96GM1 343 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 KIRREL1Q96J84 757 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PKIBQ9C010 78 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 HRH4Q9H3N8 390 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 Q9N2K0 584 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 GLRX2Q9NS18 164 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC7A10Q9NS82 523 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 CLCF1Q9UBD9 225 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF175Q9Y473 711 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A096LNT2 108 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 BTBD17A6NE02 478 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 MSGN1A6NI15 193 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 CD300LBA8K4G0 201 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 UMAD1C9J7I0 102 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 C16orf97H3BN30 126 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 OVOL3O00110 214 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 DEGS1O15121 323 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXO24O75426 580 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 IGKV1D-12P01611 117 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PRH1P02810 166 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PATE4P0C8F1 98 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A6P12236 298 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PRKACAP17612 351 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ANOS1P23352 680 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 HAAOP46952 286 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 CAMLGP49069 296 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 GPM6AP51674 278 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TGFBR3Q03167 851 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 HGFACQ04756 655 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 BAXQ07812 192 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TBC1D28Q2M2D7 210 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PHLDA2Q53GA4 152 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 DMRTC1Q5HYR2 192 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM268Q5VZI3 342 aa5.93□□□□□ -1.46
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