RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 OR10A7Q8NGE5 316 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 FRZBQ92765 325 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 TMEM18Q96B42 140 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 CLDND2Q8NHS1 167 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 LURAP1Q96LR2 239 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 PROK2Q9HC23 129 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 PITPNC1Q9UKF7 332 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 LTC4SQ16873 150 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 C17orf78Q8N4C9 275 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 MPDU1O75352 247 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 UCP2P55851 309 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 RTL8BQ17RB0 113 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 C22orf15Q8WYQ4 148 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 RBKSQ9H477 322 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 A0A0U1RQK1 487 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 CLDN14O95500 239 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 SRP14P37108 136 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 EDDM3BP56851 147 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 TAS2R45P59539 299 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 R3HDM4Q96D70 268 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 DEPPQ9NTK1 212 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 OR6C3Q9NZP0 311 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 AGAP20933 346 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 Q3ZCU0 254 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 NMSQ5H8A3 153 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 FGFBP3Q8TAT2 258 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 OR2J1Q9GZK6 312 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 PSG11Q9UQ72 335 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 LRRC30A6NM36 301 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 CRYAAP02489 173 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 TNFRSF9Q07011 255 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 NCMAPQ5T1S8 102 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 FGFRL1Q8N441 504 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 WDR31Q8NA23 367 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 LRRC29Q8WV35 223 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 COA4Q9NYJ1 87 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 RAB4BP61018 213 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 HES3Q5TGS1 186 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 OR1A1Q9P1Q5 309 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 MIOXQ9UGB7 285 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 DUSP13Q9UII6 198 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 C5orf52A6NGY3 159 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 IFNL4K9M1U5 179 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 HPRT1P00492 218 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 FOSL1P15407 271 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 FABP6P51161 128 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 ICAM4Q14773 271 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 C3AR1Q16581 482 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A22Q9H936 323 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 COL4A2P08572 1712 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 TMEM250H0YL14 139 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 H0YL77 283 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 M0R1X1 148 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 LYZL6O75951 148 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 HRASP01112 189 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 APOA2P02652 100 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 CCKARP32238 428 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 PMP22Q01453 160 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 DEFB123Q8N688 67 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 Q8NFD4 153 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 OR4S2Q8NH73 311 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 HPSE2Q8WWQ2 592 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.52□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa7.52□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 PROB1E7EW31 1015 aa7.52□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 HBZP02008 142 aa7.52□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 IGKV1-13P0DP09 117 aa7.52□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 G6PCP35575 357 aa7.52□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms