RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM90A10PA6NDY2 464 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM90A18PA6NE21 464 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM90A16PA6NEW6 464 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM90A7PA6NKC0 464 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM90A22PA8MWA6 464 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM90A12PA8MX19 464 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 WRBO00258 174 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 MPPED1O15442 326 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 ANGPTL7O43827 346 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 NRASP01111 189 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 DBHP09172 617 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM90A15PP0C7V4 464 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM90A13PP0C7W8 464 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM90A14PP0C7W9 464 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM90A24PP0C7X0 464 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB2AP61019 212 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 BAXQ07812 192 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35G3Q8N808 338 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2G3Q8NGZ4 309 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 OR1F12Q8NHA8 337 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM222BQ8WU58 562 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PPE2 198 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV2-70P01814 119 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 ARG1P05089 322 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 DAOP14920 347 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 ARF1P84077 181 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 TLE4Q04727 773 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 RTTNQ86VV8 2226 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PPR1 153 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF732B4DXR9 585 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FBP1P09467 338 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 OR13C7P0DN81 318 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXA5P20719 270 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR31Q8NA23 367 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 MUCL1Q96DR8 90 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5H1A6NKK0 313 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB108AA8MXU0 73 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 PPIHO43447 177 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FUT3P21217 361 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM209BQ5JX69 171 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 TOLLIPQ9H0E2 274 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 ST3GAL6Q9Y274 331 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 A6NNC1 897 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 PPYP01298 95 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 HBE1P02100 147 aa22.26■■□□□ 1.15
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR1K1Q8NGR3 316 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 HS3ST6Q96QI5 342 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 DMRT1Q9Y5R6 373 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 NAV2Q8IVL1 2488 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6C6A6NF89 314 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 AADACP22760 399 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6V0CP27449 155 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 DPPA2Q7Z7J5 298 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00469Q8N7U9 141 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 TXNL1O43396 289 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 HTR5AP47898 357 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM11P57052 281 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 VAMP2P63027 116 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10G4Q8NGN3 311 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 TP53RKQ96S44 253 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 PDZD2O15018 2839 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX15Q9BXT5 2789 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV20A0A0B4J274 112 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM221AA4D161 298 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 B4DEV8 164 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 LCATP04180 440 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 OR8G1Q15617 311 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 TIMM23BQ5SRD1 257 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF695Q8IW36 515 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A15Q9Y619 301 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 PCBD1P61457 104 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF506Q5JVG8 444 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 SPSB3Q6PJ21 355 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 Q8NFD4 153 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 OR13D1Q8NGV5 346 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 NRGNQ92686 78 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS13CQ709C8 3753 aa22.23■■□□□ 1.15
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