RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031377.8

Scarb2-201, Transcript of Lysosome membrane protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scarb2, Length 4,698 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rcc1lQ9CYF5 461 aa11.92□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Arrdc2Q9D668 407 aa11.92□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mllt1Q9ERL0 547 aa11.92□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Zfp433A0A0J9YUD4 600 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm32687A0A1W2P6H7 600 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr750E9Q0Z1 331 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Bcat2O35855 393 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rps16P14131 146 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rhox10Q4TU83 196 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Klf3Q60980 344 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tbpl2Q6SJ95 350 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr1386Q7TQT0 309 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 SdhdQ9CXV1 159 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Spaca7Q9D2S4 182 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Abhd16aQ9Z1Q2 558 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr747E9PXH6 313 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr749E9Q438 313 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 MosP00536 390 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tcrg-V1P06325 135 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Klk1b26P36369 261 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 PtgfrP43117 366 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Hist1h1dP43277 221 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm5771Q792Y9 245 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nudt9Q8BVU5 350 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Fam169bQ8CHT6 337 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr654Q8VF27 341 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mtfp1Q9CRB8 166 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mapk7Q9WVS8 806 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Thbs4Q9Z1T2 963 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm14597A2CFG5 200 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm438B1ASB3 393 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm17657E9PWY5 170 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Atpif1O35143 106 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Atf6bO35451 699 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nxph1Q61200 271 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Foxb1Q64732 325 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr126Q8VGF0 319 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Wdr13Q91V09 485 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Defb7Q91V70 71 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tnfrsf19Q9JLL3 416 aa11.91□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 RorcP51450 516 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Bcl2l15Q08ED0 167 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gfod1Q3UHD2 390 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Il17rcQ8K4C2 698 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm9817Q9D2M0 144 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 EdarQ9R187 448 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm38303A0A0A6YWW8 100 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Vmn1r138D3YTY2 306 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm8693E9PW18 306 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Zfp760E9QAF5 666 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm42421F6X8D5 166 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm5225J3QPL3 108 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm4498K9J7G4 306 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Vmn1r118L7N273 306 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 RelP15307 587 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Defb46Q4QY34 57 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ell3Q80VR2 395 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rdh9Q8K5C8 317 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Calhm5Q8R100 309 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Thoc3Q8VE80 351 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr1411Q8VFC4 323 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 B3gat1Q9CW73 334 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Lyl1P27792 278 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nanos2P60322 136 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Polr2gP62488 172 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ctf2P83714 204 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nkpd1Q0VF94 599 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ceacam12Q3UKP4 300 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm10762Q9CZN6 115 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Zfand6Q9DCH6 223 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tex101Q9JMI7 250 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tusc2Q9WVF8 110 aa11.9□□□□□ -0.5
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr250E9PV37 331 aa11.9□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 P01881 257 aa11.9□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Id4P41139 161 aa11.9□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Sec14l3Q5SQ27 401 aa11.9□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 HykkQ5U5V2 376 aa11.9□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Slc35e3Q6PGC7 313 aa11.9□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Sh2d7Q8BI17 458 aa11.9□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rab31Q921E2 194 aa11.9□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rab32Q9CZE3 223 aa11.9□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Wdr20Q9D5R2 567 aa11.9□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Arxes1C0HK79 180 aa11.89□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Arxes2C0HK80 180 aa11.89□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cdhr4H3BJZ2 783 aa11.89□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Prss12O08762 761 aa11.89□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Samt2Q497M0 247 aa11.89□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Smug1Q6P5C5 279 aa11.89□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 LiphQ8CIV3 451 aa11.89□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 MrgprfQ8VCJ6 343 aa11.89□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ucn3Q924A4 164 aa11.89□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 TsfmQ9CZR8 324 aa11.89□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Dcbld1Q9D4J3 503 aa11.89□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ifna7P06799 190 aa11.89□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tdpoz1P0DMR5 365 aa11.89□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Slc7a10P63115 530 aa11.89□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Btg2Q04211 158 aa11.89□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 PiglQ5SX19 252 aa11.89□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 MaoaQ64133 526 aa11.89□□□□□ -0.51
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm13757Q7TR17 305 aa11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.5 ms