RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625245.2

SMN1-211, Transcript of survival of motor neuron 1, telomeric, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SMN1, Length 885 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1-211ENST00000625245 MUL1Q969V5 352 aa14.76□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.76□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 OR2S2Q9NQN1 319 aa14.76□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 PARP11Q9NR21 331 aa14.76□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.76□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 CKLFQ9UBR5 152 aa14.76□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 ZNF580Q9UK33 172 aa14.76□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
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SMN1-211ENST00000625245 DYNC1I1O14576 645 aa14.75□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 OGG1O15527 345 aa14.75□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 LANCL1O43813 399 aa14.75□□□□□ -0.05
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SMN1-211ENST00000625245 INSL3P51460 131 aa14.75□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 ACTBP60709 375 aa14.75□□□□□ -0.05
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SMN1-211ENST00000625245 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.75□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 FAM27D1Q5T7N8 215 aa14.75□□□□□ -0.05
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SMN1-211ENST00000625245 GHSRQ92847 366 aa14.75□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 SMIM19Q96E16 107 aa14.75□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 RITA1Q96K30 269 aa14.75□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.75□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 OR51J1Q9H342 316 aa14.75□□□□□ -0.05
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SMN1-211ENST00000625245 BABAM2Q9NXR7 383 aa14.75□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
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SMN1-211ENST00000625245 A0A1W2PPK0 400 aa14.74□□□□□ -0.05
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SMN1-211ENST00000625245 ATP6V0E1O15342 81 aa14.74□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 CNTFRP26992 372 aa14.74□□□□□ -0.05
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SMN1-211ENST00000625245 STEAP3Q658P3 488 aa14.74□□□□□ -0.05
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SMN1-211ENST00000625245 C5orf24Q7Z6I8 188 aa14.74□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 ZFP41Q8N8Y5 198 aa14.74□□□□□ -0.05
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SMN1-211ENST00000625245 DCUN1D4Q92564 292 aa14.74□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 SELENOIQ9C0D9 397 aa14.74□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.74□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 KCNIP1Q9NZI2 227 aa14.74□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 TRAV41A0A0B4J266 112 aa14.73□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa14.73□□□□□ -0.05
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SMN1-211ENST00000625245 WBP4O75554 376 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
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SMN1-211ENST00000625245 MUC7Q8TAX7 377 aa14.73□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa14.73□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 ANKRD60Q9BZ19 345 aa14.73□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 ISYNA1Q9NPH2 558 aa14.73□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 NBR2O15453 112 aa14.72□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 SAP30O75446 220 aa14.72□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 GPX5O75715 221 aa14.72□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 IGLV1-40P01703 118 aa14.72□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 RUNX1Q01196 453 aa14.72□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 LIN54Q6MZP7 749 aa14.72□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 ZNF555Q8NEP9 628 aa14.72□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 CYYR1Q96J86 154 aa14.72□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 RCHY1Q96PM5 261 aa14.72□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 CLEC2DQ9UHP7 191 aa14.72□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa14.71□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 IRGMA1A4Y4 181 aa14.71□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 CA11O75493 328 aa14.71□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 HLA-DRB1P01911 266 aa14.71□□□□□ -0.05
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SMN1-211ENST00000625245 MGMTP16455 207 aa14.71□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 FUT3P21217 361 aa14.71□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 OR3A3P47888 321 aa14.71□□□□□ -0.05
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SMN1-211ENST00000625245 CASC10Q5T4H9 136 aa14.71□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 ODF3L1Q8IXM7 274 aa14.71□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 GAPTQ8N292 157 aa14.71□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 NABP2Q9BQ15 211 aa14.71□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 KIAA1456Q9P272 454 aa14.71□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 ERGIC3Q9Y282 383 aa14.71□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SMN1-211ENST00000625245 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
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