RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 ORAI1Q96D31 301 aa6.39□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 SMIM19Q96E16 107 aa6.39□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 S100A14Q9HCY8 104 aa6.39□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.39□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.39□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.39□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 U3KQK5 164 aa6.39□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 COL7A1Q02388 2944 aa6.39□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 A0A1W2PP11 408 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 SLC31A2O15432 143 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 LANCL1O43813 399 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 BAG2O95816 211 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 HBZP02008 142 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 VHLP40337 213 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 INSL3P51460 131 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 ZNF137PP52743 207 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 MORN2Q502X0 79 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 OR11H1Q8NG94 326 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 OR1L1Q8NH94 360 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 MUL1Q969V5 352 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 TMEM80Q96HE8 168 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 KCTD7Q96MP8 289 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 RDH12Q96NR8 316 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 CITED4Q96RK1 184 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 PRR25Q96S07 402 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 SCOCQ9UIL1 159 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 ZNF580Q9UK33 172 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 LRRC42Q9Y546 428 aa6.38□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 A0A1W2PPK0 400 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 UBE2QL1A1L167 161 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 SC5DO75845 299 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 RGS11O94810 467 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 MAS1P04201 325 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 OR8U8P0C7N1 319 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 PSMB8P28062 276 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 CAPGP40121 348 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 CFHR3Q02985 330 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 LSAMPQ13449 338 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 DOC2BQ14184 412 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 MMDQ15546 238 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 TTC23Q5W5X9 447 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 AWAT2Q6E213 333 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 LIN54Q6MZP7 749 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 GAPTQ8N292 157 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 OR51J1Q9H342 316 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 BANF2Q9H503 90 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 VSIG4Q9Y279 399 aa6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.36□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 MAGEA13PA6NCF6 341 aa6.36□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 I3L521 148 aa6.36□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 PDCD6O75340 191 aa6.36□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 LY86O95711 162 aa6.36□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 LALBAP00709 142 aa6.36□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 MGMTP16455 207 aa6.36□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 FSTP19883 344 aa6.36□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 MYF6P23409 242 aa6.36□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 RAB9AP51151 201 aa6.36□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 TAS2R43P59537 309 aa6.36□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 ACTBP60709 375 aa6.36□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 HTD2P86397 168 aa6.36□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 RUNX1Q01196 453 aa6.36□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 ST3GAL4Q11206 333 aa6.36□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 FHL3Q13643 280 aa6.36□□□□□ -1.39
COCH-211ENST00000557065 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms