RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	TNFRSF14	Q92956	283 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	ZNF714	Q96N38	554 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	B9D2	Q9BPU9	175 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	PECR	Q9BY49	303 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PPE2	198 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PR64	198 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PRV1	198 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	CCDC160	A6NGH7	325 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	NPFF	O15130	113 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	FBP1	P09467	338 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	KIR2DS4	P43632	304 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222		Q6ZS46	218 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	RAB3C	Q96E17	227 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	MEIOC	A2RUB1	952 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	MFNG	O00587	321 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	SCGN	O76038	276 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	NAPSA	O96009	420 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	GZMH	P20718	246 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	SAA4	P35542	130 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	GLP1R	P43220	463 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	ERVFRD-1	P60508	538 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	AJUBA	Q96IF1	538 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	SSX3	Q99909	188 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	ABCG5	Q9H222	651 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	AK3	Q9UIJ7	227 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222		U3KQK5	164 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222		A0A0A6YYH2	397 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222		A6NJ64	397 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	MMP23A	O75900	390 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	SOX6	P35712	828 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	ARL6IP1	Q15041	203 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	CDNF	Q49AH0	187 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	CASC10	Q5T4H9	136 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	OR4K15	Q8NH41	348 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	AP3S1	Q92572	193 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	ASCL2	Q99929	193 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	ZNF702P	Q9H963	129 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	CALY	Q9NYX4	217 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	SERPINE3	A8MV23	424 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	C15orf65	H3BRN8	121 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	ORC5	O43913	435 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	GNB3	P16520	340 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	CDK2	P24941	298 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	SSTR5	P35346	364 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	HCP5	Q6MZN7	132 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	CCDC107	Q8WV48	283 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	CMTM3	Q96MX0	182 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	OR4F4	Q96R69	305 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	DIABLO	Q9NR28	239 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	APOA1	P02647	267 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	GDNF	P39905	211 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	UBE2E1	P51965	193 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	C6orf183	Q5T699	404 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-231	ENST00000552222	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		11.06	□□□□□ -0.64

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