RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	C6orf183	Q5T699	404 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204		Q6ZT83	130 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204		Q6ZTI0	123 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	ACBD4	Q8NC06	268 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	TBX5	Q99593	518 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	MGLL	Q99685	303 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	TENM3	Q9P273	2699 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204		A0A1B0GVG6	124 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	DHRS12	A0PJE2	317 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204		H3BSA7	217 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	ZMPSTE24	O75844	475 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	CTSE	P14091	401 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	SLC25A16	P16260	332 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	GABARAPL2	P60520	117 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	RASL11A	Q6T310	242 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	NCKAP5	O14513	1909 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	NOTCH1	P46531	2555 aa		0.55	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	MGAT4D	A6NG13	374 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	C11orf86	A6NJI1	115 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	GNRH2	O43555	120 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	AKR1C4	P17516	323 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	UGT2B10	P36537	528 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	SLC35A2	P78381	396 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	CD164	Q04900	197 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	PDK2	Q15119	407 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	VAMP3	Q15836	100 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	MAPK14	Q16539	360 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	SLC35F6	Q8N357	371 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	MND1	Q9BWT6	205 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	XKR8	Q9H6D3	395 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204		A8MUN3	132 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	OTC	P00480	354 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	ESD	P10768	282 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	G6PC	P35575	357 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	RAP1GDS1	P52306	607 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	AQP5	P55064	265 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	TSPAN5	P62079	268 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF90	Q03938	601 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	NAA40	Q86UY6	237 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	MITD1	Q8WV92	249 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	OR51E2	Q9H255	320 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	ALG5	Q9Y673	324 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		0.53	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		0.53	□□□□□ -2.33
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM235	A6NFC5	223 aa		0.52	□□□□□ -2.33
MDM2-233	ENST00000545204		C9J4A7	227 aa		0.52	□□□□□ -2.33
MDM2-233	ENST00000545204	FABP7	O15540	132 aa		0.52	□□□□□ -2.33
MDM2-233	ENST00000545204	CDK14	O94921	469 aa		0.52	□□□□□ -2.33
MDM2-233	ENST00000545204	VSNL1	P62760	191 aa		0.52	□□□□□ -2.33
MDM2-233	ENST00000545204	RELA	Q04206	551 aa		0.52	□□□□□ -2.33
MDM2-233	ENST00000545204	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	0.52	□□□□□ -2.33
MDM2-233	ENST00000545204	SSX6	Q7RTT6	188 aa		0.52	□□□□□ -2.33
MDM2-233	ENST00000545204	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		0.52	□□□□□ -2.33
MDM2-233	ENST00000545204	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		0.52	□□□□□ -2.33

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