RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 RAB22AQ9UL26 194 aa9.24□□□□□ -0.93
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UBASH3B-208ENST00000533451 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
UBASH3B-208ENST00000533451 SDC2P34741 201 aa9.23□□□□□ -0.93
UBASH3B-208ENST00000533451 EFNB2P52799 333 aa9.23□□□□□ -0.93
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UBASH3B-208ENST00000533451 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa9.23□□□□□ -0.93
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa9.23□□□□□ -0.93
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UBASH3B-208ENST00000533451 MOB3BQ86TA1 216 aa9.23□□□□□ -0.93
UBASH3B-208ENST00000533451 OR52M1Q8NGK5 317 aa9.23□□□□□ -0.93
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UBASH3B-208ENST00000533451 GALMQ96C23 342 aa9.23□□□□□ -0.93
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UBASH3B-208ENST00000533451 A6NDX4 124 aa9.22□□□□□ -0.93
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UBASH3B-208ENST00000533451 RGS11O94810 467 aa9.22□□□□□ -0.93
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UBASH3B-208ENST00000533451 HNF4GQ14541 408 aa9.22□□□□□ -0.93
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UBASH3B-208ENST00000533451 C5orf24Q7Z6I8 188 aa9.22□□□□□ -0.93
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UBASH3B-208ENST00000533451 OR52L2PQ8NGH6 319 aa9.22□□□□□ -0.93
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UBASH3B-208ENST00000533451 ARFRP1Q13795 201 aa9.21□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa9.21□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 IDNKQ5T6J7 187 aa9.21□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 SFXN4Q6P4A7 337 aa9.21□□□□□ -0.94
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UBASH3B-208ENST00000533451 OR10R2Q8NGX6 335 aa9.21□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 LGALS14Q8TCE9 139 aa9.21□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 PRSS22Q9GZN4 317 aa9.21□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF696Q9H7X3 374 aa9.21□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 FBLN5Q9UBX5 448 aa9.21□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 HSF4Q9ULV5 492 aa9.21□□□□□ -0.94
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UBASH3B-208ENST00000533451 LDLRAD4O15165 306 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 TSPAN9O75954 239 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 NAPSAO96009 420 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 IGKV1D-33P01593 117 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 IGKV1-33P01594 117 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 GNB3P16520 340 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM11P17152 192 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 RAB6AP20340 208 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 TALDO1P37837 337 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 HMGN3Q15651 99 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 MOGAT2Q3SYC2 334 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 PLAC9Q5JTB6 97 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 OR8H3Q8N146 312 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM89BQ8N5H3 189 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 DTX3Q8N9I9 347 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 OR2AK2Q8NG84 335 aa9.2□□□□□ -0.94
UBASH3B-208ENST00000533451 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa9.2□□□□□ -0.94
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