RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa11.28□□□□□ -0.6
UBASH3B-202ENST00000525711 BANF2Q9H503 90 aa11.28□□□□□ -0.6
UBASH3B-202ENST00000525711 SPACA1Q9HBV2 294 aa11.28□□□□□ -0.6
UBASH3B-202ENST00000525711 RAB22AQ9UL26 194 aa11.28□□□□□ -0.6
UBASH3B-202ENST00000525711 LINC00312Q9Y6C7 94 aa11.28□□□□□ -0.6
UBASH3B-202ENST00000525711 STAB2Q8WWQ8 2551 aa11.28□□□□□ -0.6
UBASH3B-202ENST00000525711 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa11.27□□□□□ -0.6
UBASH3B-202ENST00000525711 SIRPB1O00241 398 aa11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 MGST3O14880 152 aa11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF44P15621 663 aa11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 RAB6AP20340 208 aa11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 GABRR1P24046 479 aa11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 TGFBR1P36897 503 aa11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 OR3A1P47881 315 aa11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 CLDN12P56749 244 aa11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 EDDM3AQ14507 147 aa11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 OR10K2Q6IF99 312 aa11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 C8orf86Q6ZUL3 223 aa11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 TCF23Q7RTU1 214 aa11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 OR4P4Q8NGL7 312 aa11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF596Q8TC21 504 aa11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM46BQ96A09 425 aa11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC25A46Q96AG3 418 aa11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM59Q9BXS4 323 aa11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 ZFP57Q9NU63 452 aa11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 DPM3Q9P2X0 92 aa11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 DAPK2Q9UIK4 370 aa11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 FUOMA2VDF0 154 aa11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 FUT3P21217 361 aa11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 CEACAM3P40198 252 aa11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 SERPINB10P48595 397 aa11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 RAB25P57735 213 aa11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 GRK1Q15835 563 aa11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 NKAPLQ5M9Q1 402 aa11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 OR52W1Q6IF63 320 aa11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF329Q86UD4 541 aa11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 RTN4RL2Q86UN3 420 aa11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 SUMF2Q8NBJ7 301 aa11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 CHPT1Q8WUD6 406 aa11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 BARHL1Q9BZE3 327 aa11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 LPAR5Q9H1C0 372 aa11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 ABRACLQ9P1F3 81 aa11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 CEPT1Q9Y6K0 416 aa11.26□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 TENM2Q9NT68 2774 aa11.25□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 SMIM30A4D0T7 59 aa11.25□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 LEUTXA8MZ59 168 aa11.25□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 RORCP51449 518 aa11.25□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 IDNKQ5T6J7 187 aa11.25□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 SIGIRRQ6IA17 410 aa11.25□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 CREB3L1Q96BA8 519 aa11.25□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 P2RX4Q99571 388 aa11.25□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 ASCL2Q99929 193 aa11.25□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 DCSTAMPQ9H295 470 aa11.25□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 PALMDQ9NP74 551 aa11.25□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 MOB4Q9Y3A3 225 aa11.25□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 ETV7Q9Y603 341 aa11.25□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 METTL21EPA6NDL7 271 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 MCRIP1C9JLW8 97 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 PDCD6O75340 191 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 CA11O75493 328 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 AMY1AP04745 511 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 AMY2AP04746 511 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 CHATP28329 748 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 MNDAP41218 407 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 P2RX3P56373 397 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC35B1P78383 322 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 ATAD3CQ5T2N8 411 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 C9orf66Q5T8R8 295 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 RAB12Q6IQ22 244 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 ABHD12Q8N2K0 398 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 COMMD1Q8N668 190 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 OR56B1Q8NGI3 324 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 CORO2AQ92828 525 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 PRR25Q96S07 402 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 CHST6Q9GZX3 395 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 KCNK15Q9H427 330 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF581Q9P0T4 197 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 HSF4Q9ULV5 492 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 PEX16Q9Y5Y5 336 aa11.24□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A0A6YYD4 124 aa11.23□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A0B4J203 849 aa11.23□□□□□ -0.61
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms