RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 INMTO95050 263 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 NXPH4O95158 308 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CST4P01036 141 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 IL1AP01583 271 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 MT-ND1P03886 318 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 GYPCP04921 128 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLEC2LP0C7M8 214 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 APELAP0DMC3 54 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 KITP10721 976 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF44P15621 663 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 MGMTP16455 207 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF3P17036 446 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 C4BPBP20851 252 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 GALP22466 123 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CRABP1P29762 137 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 HTR1FP30939 366 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAS1LP35410 378 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CX3CR1P49238 355 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SERPINB8P50452 374 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNU13P55769 128 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDC42P60953 191 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 DSTNP60981 165 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST1H3AP68431 136 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCN1BQ07699 218 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PJVKQ0ZLH3 352 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 LSAMPQ13449 338 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FXYD3Q14802 87 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIAA0040Q15053 153 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ESRGQ1W209 222 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 C15orf32Q32M92 178 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC01620Q4KN68 170 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF684Q5T5D7 378 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC18B1Q6NT16 456 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST2H3AQ71DI3 136 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM57BQ71RH2 274 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q8IYB0 196 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF664Q8N3J9 261 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 C10orf126Q8N4M7 172 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCNYL1Q8N7R7 359 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FNDC5Q8NAU1 212 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 NPBQ8NG41 125 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR10A7Q8NGE5 316 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR51L1Q8NGJ5 315 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR4C16Q8NGL9 310 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 C7orf33Q8WU49 177 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 GLMPQ8WWB7 406 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 HPSE2Q8WWQ2 592 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFT81Q8WYA0 676 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 GHSRQ92847 366 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM46BQ96A09 425 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPSB4Q96A44 273 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 DPH3Q96FX2 82 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CEP19Q96LK0 163 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PANX1Q96RD7 426 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHP1Q99653 195 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 KCNJ15Q99712 375 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM208Q9BTX3 173 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 C20orf24Q9BUV8 137 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ALG8Q9BVK2 526 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SYT4Q9H2B2 425 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAD21L1Q9H4I0 556 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAB9BQ9NP90 201 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 XCL2Q9UBD3 114 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RHCGQ9UBD6 479 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ENOPH1Q9UHY7 261 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ING4Q9UNL4 249 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A0J9YY99 117 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 DPPA5A6NC42 116 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 LYRM9A8MSI8 78 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF878C9JN71 531 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 J3KTA2 159 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 J3QRK9 145 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FCN1O00602 326 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SDHDO14521 159 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCSO14618 274 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRIM13O60858 407 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SERPINB7O75635 380 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCNB2O95067 398 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDUFA3O95167 84 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANP32DO95626 131 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGHV3-23P01764 117 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FGGP02679 453 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CD5P06127 495 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CRYGDP07320 174 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR9G9P0C7N8 305 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00032P0C843 101 aa1.24□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms