RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 RBKSQ9H477 322 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 C12orf49Q9H741 205 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CDH20Q9HBT6 801 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM206AQ9NX38 181 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 KLK11Q9UBX7 282 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 OR6C6A6NF89 314 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 RER1O15258 196 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 SYNGR3O43761 229 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 SCGB1D1O95968 90 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 CST4P01036 141 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 OR8U9P0C7N5 309 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 AKAIN1P0CW23 69 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 PGA5P0DJD9 388 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 CCNOP22674 350 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ERVS71-1P61550 626 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF676Q8N7Q3 588 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF596Q8TC21 504 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 DCUN1D4Q92564 292 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 SPTSSAQ969W0 71 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ERGIC1Q969X5 290 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC6A7Q99884 636 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2H1Q9GZK4 316 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 PROCRQ9UNN8 238 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 B4DEV8 164 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 H0Y8G0 127 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 CGAP01215 116 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3-9P01782 118 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 GTF2F2P13984 249 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF32P17041 273 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 CRYGSP22914 178 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 FPR2P25090 351 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 PRDX4Q13162 271 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 Q499Y3 187 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 DOLPP1Q86YN1 238 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 C17orf78Q8N4C9 275 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 STARD4Q96DR4 205 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB27BO00194 218 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNHIT1O43257 154 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 RAMP3O60896 148 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 GLI4P10075 376 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 LYL1P12980 280 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ANOS1P23352 680 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ZBTB25P24278 435 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 CD1BP29016 333 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 CX3CR1P49238 355 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 RHOGP84095 191 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 PSG4Q00888 419 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 P2RY6Q15077 328 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 PRSS8Q16651 343 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM211Q6ICI0 200 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 PRR27Q6MZM9 219 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 LFNGQ8NES3 379 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 REEP6Q96HR9 211 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 DERL3Q96Q80 235 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 GINS3Q9BRX5 216 aa6.2□□□□□ -1.42
SMARCE1-211ENST00000493660 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
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