RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	GAPT	Q8N292	157 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	TMED9	Q9BVK6	235 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	ZFP57	Q9NU63	452 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	COL7A1	Q02388	2944 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	AP4M1	O00189	453 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	PDCD6	O75340	191 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	SC5D	O75845	299 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	CD1A	P06126	327 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	MYF6	P23409	242 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	GPR50	Q13585	617 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	DEFB136	Q30KP8	78 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618		Q3ZCU0	254 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	MORN2	Q502X0	79 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF695	Q8IW36	515 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	RAB9B	Q9NP90	201 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	PTGES3L	E9PB15	166 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	TXNL1	O43396	289 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	CDK1	P06493	297 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	MYCNOS	P40205	109 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF137P	P52743	207 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	LSAMP	Q13449	338 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	TEX38	Q6PEX7	206 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	COMMD1	Q8N668	190 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	DPF1	Q92782	380 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	RAX2	Q96IS3	184 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	P2RX4	Q99571	388 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	MND1	Q9BWT6	205 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	CA11	O75493	328 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	VSIG8	P0DPA2	414 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	CNTFR	P26992	372 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	RITA1	Q96K30	269 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	NICN1	Q9BSH3	213 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	CST11	Q9H112	138 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618		H0YHG0	523 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	CCL24	O00175	119 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	LANCL1	O43813	399 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	GLA	P06280	429 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	VDAC1	P21796	283 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	CHAT	P28329	748 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	SOX6	P35712	828 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	OR3A3	P47888	321 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	MED22	Q15528	200 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	SETD6	Q8TBK2	473 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	THRSP	Q92748	146 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	VCX	Q9H320	206 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	GHRL	Q9UBU3	117 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	JPT1	Q9UK76	154 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	UBB	P0CG47	229 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	HTR2C	P28335	458 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	CFHR3	Q02985	330 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	UNC119	Q13432	240 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	FOXE3	Q13461	319 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	MMD	Q15546	238 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	HMGN3	Q15651	99 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		11.47	□□□□□ -0.57

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