RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489842.1

GTF3C5-210, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 5, humanhuman

TSL 2

Gene GTF3C5, Length 696 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5-210ENST00000489842 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.12□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.12□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 ZNF695Q8IW36 515 aa7.12□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 FOXRED2Q8IWF2 684 aa7.12□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa7.12□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.12□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 ASCL2Q99929 193 aa7.12□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.12□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 TMED9Q9BVK6 235 aa7.12□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa7.12□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.12□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 H0YHG0 523 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 AP4M1O00189 453 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 HTR2CP28335 458 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 CD1BP29016 333 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 CAPGP40121 348 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 WNT4P56705 351 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 SLC35B1P78383 322 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 NDPQ00604 133 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 PLA2G7Q13093 441 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 LSAMPQ13449 338 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 ACSM3Q53FZ2 586 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 TTC23Q5W5X9 447 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 LINC00596Q86U02 117 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 LRRTM1Q86UE6 522 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 GAPTQ8N292 157 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 STX19Q8N4C7 294 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 NANOGP1Q8N7R0 232 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 OR51D1Q8NGF3 324 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 KCTD7Q96MP8 289 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 GFI1Q99684 422 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 NABP2Q9BQ15 211 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 ZFP57Q9NU63 452 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 CKLFQ9UBR5 152 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 FBXO7Q9Y3I1 522 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 EFCAB10A6NFE3 127 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 PTGES3LE9PB15 166 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 MYL12BO14950 172 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 ATP6V0E1O15342 81 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 ST8SIA5O15466 376 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 SPINT2O43291 252 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 PDCD6O75340 191 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 SC5DO75845 299 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 FUT3P21217 361 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 CHATP28329 748 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 ZNF137PP52743 207 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 GNB1P62873 340 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 CD69Q07108 199 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 UNC119Q13432 240 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 P2RY14Q15391 338 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 MMDQ15546 238 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 RPL39P5Q59GN2 51 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 C6orf141Q5SZD1 244 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 C6orf183Q5T699 404 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 TEX38Q6PEX7 206 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 C10orf67Q8IYJ2 551 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 SETD9Q8NE22 299 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 SETD6Q8TBK2 473 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 TMEM203Q969S6 136 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 ABHD14BQ96IU4 210 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 PARP11Q9NR21 331 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 FKBP14Q9NWM8 211 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 SCOCQ9UIL1 159 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 GAB2Q9UQC2 676 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.1□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.09□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.09□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 IRGMA1A4Y4 181 aa7.09□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 FCN1O00602 326 aa7.09□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 SOCS1O15524 211 aa7.09□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 SOX15O60248 233 aa7.09□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 IGHG4P01861 327 aa7.09□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 CDK1P06493 297 aa7.09□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 IL3RAP26951 378 aa7.09□□□□□ -1.27
GTF3C5-210ENST00000489842 PSMB8P28062 276 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.2 ms