RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 HCCSP53701 268 aa-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPS15P62841 145 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 C2orf80Q0P641 193 aa-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 BNIP2Q12982 314 aa-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 SKP2Q13309 424 aa-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRAMEF20Q5VT98 475 aa-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 CARD17Q5XLA6 110 aa-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 SSX7Q7RTT5 188 aa-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 SBSPONQ8IVN8 264 aa-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR52K1Q8NGK4 314 aa-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 MCUR1Q96AQ8 359 aa-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 TBC1D31Q96DN5 1066 aa-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 CHP1Q99653 195 aa-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 COA1Q9GZY4 146 aa-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 C6orf50Q9HD87 102 aa-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 C12orf4Q9NQ89 552 aa-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 NMRK1Q9NWW6 199 aa-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 TBC1D24Q9ULP9 559 aa-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC22A14Q9Y267 594 aa-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 USH1CQ9Y6N9 552 aa-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCN9AQ15858 1988 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 SYNJ1O43426 1573 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADAMTSL3P82987 1691 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM235A6NFC5 223 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 GATCO43716 136 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPOPO43791 374 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 DNAJB6O75190 326 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 PTTG1O95997 202 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 LTAP01374 205 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGKV1D-12P01611 117 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 RLN2P04090 185 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 PTMAP06454 111 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 CRYGDP07320 174 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATF1P18846 271 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 GTF2H1P32780 548 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 AKR1C3P42330 323 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR2B6P58173 313 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 DNAJC3Q13217 504 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPCS2Q15005 226 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARMC12Q5T9G4 340 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 NELFCDQ8IXH7 590 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM19A2Q8N3H0 131 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR6K3Q8NGY3 331 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNRF2Q8NHG8 242 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 AKR7LQ8NHP1 331 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 ING5Q8WYH8 240 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 TBX5Q99593 518 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 C20orf144Q9BQM9 153 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 TM6SF2Q9BZW4 377 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 ELOVL6Q9H5J4 265 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 STK38LQ9Y2H1 464 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYOFQ9NZM1 2061 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 HECW2Q9P2P5 1572 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa-0.36□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 DHRS12A0PJE2 317 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 GOLGA8OA6NCC3 632 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 C2orf74A8MZ97 194 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 GOLGA8NF8WBI6 632 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 M0R1B8 84 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 LSM1O15116 133 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 SOD1P00441 154 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 CA2P00918 260 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 NPPAP01160 153 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR4A8P0C604 315 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 CTSEP14091 401 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 GSTM3P21266 225 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 EVX1P49640 407 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATP6V0D1P61421 351 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 PAFAH1B2P68402 229 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 RBM3P98179 157 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPANXN2Q5MJ10 180 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM27D1Q5T7N8 215 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 UGT2A3Q6UWM9 527 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 TAS2R42Q7RTR8 314 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q8N2B8 174 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC35F6Q8N357 371 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRIML2Q8N7C3 387 aa-0.37□□□□□ -2.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 TWIST2Q8WVJ9 160 aa-0.37□□□□□ -2.47
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