RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481875.1

GARNL3-217, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-217ENST00000481875 OR4F17Q8NGA8 305 aa9.3□□□□□ -0.92
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GARNL3-217ENST00000481875 OR4F4Q96R69 305 aa9.3□□□□□ -0.92
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GARNL3-217ENST00000481875 TNFSF8P32971 234 aa9.26□□□□□ -0.93
GARNL3-217ENST00000481875 RAB13P51153 203 aa9.26□□□□□ -0.93
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