RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438547.6

SEMA4D-211, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4D, Length 4,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-211ENST00000438547 HELTA6NFD8 242 aa9.71□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 ELOBQ15370 118 aa9.71□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 VSTM2AQ8TAG5 236 aa9.71□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 RPEQ96AT9 228 aa9.71□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 ELOVL1Q9BW60 279 aa9.71□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 CLN8Q9UBY8 286 aa9.71□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF785A8K8V0 405 aa9.71□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 SNURFLB1AK76 121 aa9.71□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.71□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 CTSBP07858 339 aa9.71□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 KLK2P20151 261 aa9.71□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 IER3P46695 156 aa9.71□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 SGMS2Q8NHU3 365 aa9.71□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 CCL17Q92583 94 aa9.71□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 MS4A3Q96HJ5 214 aa9.71□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 GLRX2Q9NS18 164 aa9.71□□□□□ -0.85
SEMA4D-211ENST00000438547 SCTP09683 121 aa9.71□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 PDPNQ86YL7 162 aa9.71□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 STARD4Q96DR4 205 aa9.71□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF665Q9H7R5 613 aa9.71□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM14DPA8MWL7 114 aa9.71□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 H0Y980 276 aa9.71□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 BMPR1BO00238 502 aa9.71□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 CXorf1O96002 111 aa9.71□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 ID4P47928 161 aa9.71□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 FGF12P61328 243 aa9.71□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 DHRS11Q6UWP2 260 aa9.71□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 DEFB123Q8N688 67 aa9.71□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC25A40Q8TBP6 338 aa9.71□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 RHOVQ96L33 236 aa9.71□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa9.71□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF831Q5JPB2 1677 aa9.71□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 H0YL77 283 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 OR2J3O76001 311 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 NEURL1O76050 574 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 NPY1RP25929 384 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 EGR4Q05215 589 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 SCN2AQ99250 2005 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 S100A4P26447 101 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 AESQ08117 197 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 APCDD1LQ8NCL9 501 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 TCF21O43680 179 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 CEACAM21Q3KPI0 293 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 ABHD14BQ96IU4 210 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 SMOC1Q9H4F8 434 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 CSN3P07498 182 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 PCP4P48539 62 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 Q56UQ5 140 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 TEPPQ6URK8 271 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM108Q6UXF1 575 aa9.7□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 SOX8P57073 446 aa9.69□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 GNB2P62879 340 aa9.69□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 FBXW9Q5XUX1 488 aa9.69□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 GFRALQ6UXV0 394 aa9.69□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 RAB24Q969Q5 203 aa9.69□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 SBF2Q86WG5 1849 aa9.69□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 GAMTQ14353 236 aa9.69□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 OR1B1Q8NGR6 318 aa9.69□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 TBX15Q96SF7 602 aa9.69□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 PIPOXQ9P0Z9 390 aa9.69□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 PRNDQ9UKY0 176 aa9.69□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 R4GN57 208 aa9.69□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 RND3P61587 244 aa9.69□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 NR2C2APQ86WQ0 139 aa9.69□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 POC1AQ8NBT0 407 aa9.69□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 OR52M1Q8NGK5 317 aa9.69□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 VN1R17PQ8TDU5 208 aa9.69□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 OR2J1Q9GZK6 312 aa9.69□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 DHRS7CA6NNS2 312 aa9.68□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 A8MXK9 166 aa9.68□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 SYNGR1O43759 233 aa9.68□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 DANCRP0C864 163 aa9.68□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 CD1BP29016 333 aa9.68□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 LYZP61626 148 aa9.68□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 MOGAT3Q86VF5 341 aa9.68□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 OR2M7Q8NG81 312 aa9.68□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.68□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 NRXN2Q9P2S2 1712 aa9.68□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM87AP0C7U9 286 aa9.68□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 C2orf68Q2NKX9 166 aa9.68□□□□□ -0.86
SEMA4D-211ENST00000438547 MDP1Q86V88 176 aa9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms