RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 YPEL2Q96QA6 119 aa13.92□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 GFOD1Q9NXC2 390 aa13.92□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 RDH8Q9NYR8 311 aa13.92□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 ONECUT1Q9UBC0 465 aa13.92□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 KPTNQ9Y664 436 aa13.92□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 UNC79Q9P2D8 2635 aa13.91□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPYP01298 95 aa13.91□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 MSMBP08118 114 aa13.91□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV1-8P0DP01 117 aa13.91□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCR6P51684 374 aa13.91□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 HERV-K104P61576 105 aa13.91□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 MORN2Q502X0 79 aa13.91□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLA1AQ53H76 456 aa13.91□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 C11orf42Q8N5U0 333 aa13.91□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 MINDY2Q8NBR6 621 aa13.91□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 WFDC11Q8NEX6 87 aa13.91□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 EDARADDQ8WWZ3 215 aa13.91□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 MOB3AQ96BX8 217 aa13.91□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2W1Q9Y3N9 320 aa13.91□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 SESN1Q9Y6P5 492 aa13.91□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 TACC2O95359 2948 aa13.91□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 CENPEQ02224 2701 aa13.91□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 APCP25054 2843 aa13.9□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa13.9□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM172BPA6NC97 362 aa13.9□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 ITGB1BP1O14713 200 aa13.9□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 MMP23AO75900 390 aa13.9□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 NDUFB6O95139 128 aa13.9□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV3-43DP0DP04 118 aa13.9□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 AADACP22760 399 aa13.9□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 NFYBP25208 207 aa13.9□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERVFRD-1P60508 538 aa13.9□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 GNMTQ14749 295 aa13.9□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 LTC4SQ16873 150 aa13.9□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 AADACL3Q5VUY0 350 aa13.9□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC01356Q8N9X3 169 aa13.9□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCGB3A2Q96PL1 93 aa13.9□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa13.9□□□□□ -0.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A087X0M5 115 aa13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV20A0A0B4J274 112 aa13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1B0GX30 115 aa13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR5H14A6NHG9 310 aa13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCRBP04435 133 aa13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 GATA3P23771 443 aa13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 LUMP51884 338 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 UCP3P55916 312 aa13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARF6P62330 175 aa13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 OXA1LQ15070 435 aa13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM16LQ309B1 348 aa13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 LPCAT3Q6P1A2 487 aa13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR10V1Q8NGI7 309 aa13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR13C8Q8NGS7 320 aa13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHPT1Q8WUD6 406 aa13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 OCEL1Q9H607 264 aa13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 LPAR2Q9HBW0 351 aa13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 MMP26Q9NRE1 261 aa13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 INSIG2Q9Y5U4 225 aa13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa13.89□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAV2Q8IVL1 2488 aa13.88□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRTN3P24158 256 aa13.88□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 METTL11BQ5VVY1 283 aa13.88□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLET1Q6UQ28 207 aa13.88□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q8N7P7 452 aa13.88□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZDHHC22Q8N966 263 aa13.88□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 C8orf31Q8N9H6 132 aa13.88□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2AK2Q8NG84 335 aa13.88□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM133Q9H2Q1 129 aa13.88□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD34P28906 385 aa13.87□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 GZMKP49863 264 aa13.87□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB7AP51149 207 aa13.87□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 FXYD4P59646 89 aa13.87□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 AKAP6Q13023 2319 aa13.87□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC38A6Q8IZM9 456 aa13.87□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF439Q8NDP4 499 aa13.87□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR13D1Q8NGV5 346 aa13.87□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZFAND1Q8TCF1 268 aa13.87□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 MARCH1Q8TCQ1 289 aa13.87□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRGPRFQ96AM1 343 aa13.87□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 CREB3L1Q96BA8 519 aa13.87□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 SUCNR1Q9BXA5 334 aa13.87□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 FXYD6Q9H0Q3 95 aa13.87□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 SIRPDQ9H106 197 aa13.87□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 GHITMQ9H3K2 345 aa13.87□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa13.87□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPG11Q96JI7 2443 aa13.87□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 HECTD1Q9ULT8 2610 aa13.87□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC22A5O76082 557 aa13.86□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 TOX4O94842 621 aa13.86□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 PGAM2P15259 253 aa13.86□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 PAX8Q06710 450 aa13.86□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM249Q2WGJ8 235 aa13.86□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCAF12L2Q5VW00 463 aa13.86□□□□□ -0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms