RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 ABHD14BQ96IU4 210 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 OR2J3O76001 311 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 F12P00748 615 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM65Q6PI78 240 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC00596Q86U02 117 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 C11orf42Q8N5U0 333 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 NAT8Q9UHE5 227 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 VAX2Q9UIW0 290 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 ARID2Q68CP9 1835 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4-202ENST00000392011 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 UBE2V2Q15819 145 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 FA2HQ7L5A8 372 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 NPY1RP25929 384 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 NMBP08949 121 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 P2RY4P51582 365 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 B2MP61769 119 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 C1QL1O75973 258 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 DLK1P80370 383 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 GABRA6Q16445 453 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 FGF11Q92914 225 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 OR8B2Q96RD0 313 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 CCL13Q99616 98 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 CFDP00746 253 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 PRF1P14222 555 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 P2RY6Q15077 328 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 AQP3Q92482 292 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 PARP11Q9NR21 331 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 GOSR1O95249 250 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 OR2H2O95918 312 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM252Q8N6L7 170 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM167BQ9NRX6 74 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 PRNDQ9UKY0 176 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 RNF24Q9Y225 148 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 HBZP02008 142 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM181AQ8N9Y4 354 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 FOSL1P15407 271 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 Q5BKY6 102 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 OR2V2Q96R30 315 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 NPIPB9F8W1W9 429 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 CCL21O00585 134 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 H3BQ15 152 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 J3QR06 171 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 PDPNQ86YL7 162 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 OR10G8Q8NGN5 311 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 LOXL4Q96JB6 756 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 MANBALQ9NQG1 85 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 CLEC5AQ9NY25 188 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 PMS2P11Q13670 270 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 MS4A10Q96PG2 267 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 MGST3O14880 152 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 H2BFSP57053 126 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 MRGPRGQ86SM5 289 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 PPIAL4EA0A075B759 164 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 PRR33A8MZF0 331 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 PPIAL4DF5H284 164 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM157CP0CG43 387 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 PPIAL4FP0DN26 164 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF441Q8N8Z8 693 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 PPIAL4AQ9Y536 164 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 SIGLEC5O15389 551 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 GNG7O60262 68 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 RFPL3SP0C7P2 107 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 SP9P0CG40 484 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 TMUB1Q9BVT8 246 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 WNT5BQ9H1J7 359 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 NPTNQ9Y639 398 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 FDX2Q6P4F2 183 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC16A13Q7RTY0 426 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 KLHDC1Q8N7A1 406 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms