RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 FABP1P07148 127 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 CECR9P0C854 216 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 ATF1P18846 271 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 IFNGR2P38484 337 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 PSMD7P51665 324 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 RAP1GDS1P52306 607 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 ARF6P62330 175 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 PMVKQ15126 192 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC9A3R2Q15599 337 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF404Q494X3 552 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 ACSM3Q53FZ2 586 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 PYDC2Q56P42 97 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 SMARCD3Q6STE5 483 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 S100A7AQ86SG5 101 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 MUC15Q8N387 334 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 TBC1D19Q8N5T2 526 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC112Q8NEF3 446 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 OR1M1Q8NGA1 313 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR32P1Q8NGA4 272 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 ASB13Q8WXK3 278 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB8BQ92930 207 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 YIPF5Q969M3 257 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 TLCD1Q96CP7 247 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 SMIM12Q96EX1 92 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 SMIM8Q96KF7 97 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC42Q96M95 316 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 PEBP4Q96S96 227 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 TAPBPLQ9BX59 468 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 METTL9Q9H1A3 318 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 ASB7Q9H672 318 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 ROCK1Q13464 1354 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 NLRC5Q86WI3 1866 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 CLUHO75153 1309 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-202ENST00000370826 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 DAPL1A0PJW8 107 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 PGPA6NDG6 321 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM238C9JI98 176 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 E5RI56 91 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 C8orf87E5RJ46 101 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 H3BQV1 296 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 C15orf65H3BRN8 121 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 DENRO43583 198 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 DCTN3O75935 186 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TCRBP04435 133 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TYMSP04818 313 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 IL6P05231 212 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 OR4Q2P0C623 313 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 M6PRP20645 277 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 CFL1P23528 166 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 GRPRP30550 384 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 FMODQ06828 376 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TNFRSF9Q07011 255 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 MOGQ16653 247 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 GLYATQ6IB77 296 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 SPOPLQ6IQ16 392 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 SPNS3Q6ZMD2 512 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM231DQ6ZW35 169 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 ZIC4Q8N9L1 334 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 OR4P4Q8NGL7 312 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TEX47Q8TBZ9 253 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 DTD1Q8TEA8 209 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 C22orf15Q8WYQ4 148 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 PPCDCQ96CD2 204 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 FMC1Q96HJ9 113 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 PRSS27Q9BQR3 290 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM208Q9BTX3 173 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 CHST5Q9GZS9 411 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 MS4A6AQ9H2W1 248 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 CENPHQ9H3R5 247 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 C8orf4Q9NR00 106 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 UBQLN4Q9NRR5 601 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM206AQ9NX38 181 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 MMACHCQ9Y4U1 282 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 MYH3P11055 1940 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 PTPRKQ15262 1439 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM250H0YL14 139 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 GYG2O15488 501 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC37A4O43826 429 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 STX10O60499 249 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 IFNA16P05015 189 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-202ENST00000370826 CD99P14209 185 aa1.64□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms