RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 LTC4SQ16873 150 aa6.14□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.14□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.14□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.14□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.14□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.14□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.14□□□□□ -1.43
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SGMS1-201ENST00000361543 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.14□□□□□ -1.43
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SGMS1-201ENST00000361543 Q3ZCU0 254 aa6.13□□□□□ -1.43
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SGMS1-201ENST00000361543 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.12□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.12□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.12□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.12□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.11□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PPE3 182 aa6.11□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 SHISA3A0PJX4 238 aa6.11□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 C12orf77C9JDV5 145 aa6.11□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 C15orf65H3BRN8 121 aa6.11□□□□□ -1.43
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