RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53B-201	ENST00000280780	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	hADV38S2	A0JD32	116 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	PEX14	O75381	377 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	DHFR	P00374	187 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	DLX6	P56179	175 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	RIPPLY3	P57055	190 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	HMGN3	Q15651	99 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780		B4DSR2	109 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	FOXH1	O75593	365 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	SCT	P09683	121 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	NEURL2	Q9BR09	285 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	PRAF2	O60831	178 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	PFDN1	O60925	122 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	GSTT2	P0CG29	244 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	ERVFRD-1	P60508	538 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	HLA-DRB3	P79483	266 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	HERPUD1	Q15011	391 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	CD276	Q5ZPR3	534 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	OR1L1	Q8NH94	360 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	GINS4	Q9BRT9	223 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	ALG5	Q9Y673	324 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	TRDC	B7Z8K6	153 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	PMP2	P02689	132 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	MSMB	P08118	114 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	C6orf183	Q5T699	404 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	RFESD	Q8TAC1	157 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	GHITM	Q9H3K2	345 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	CALY	Q9NYX4	217 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	MMP23A	O75900	390 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	HBZ	P02008	142 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	OMG	P23515	440 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	CDK10	Q15131	360 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	PRR18	Q8N4B5	295 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	ARL11	Q969Q4	196 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF714	Q96N38	554 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	FABP7	O15540	132 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	CRLF1	O75462	422 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	IFNA6	P05013	189 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	IL5	P05113	134 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF728	P0DKX0	622 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	GZMH	P20718	246 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	OR3A3	P47888	321 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	IGSF11	Q5DX21	431 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	UTF1	Q5T230	341 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM186	Q96B77	213 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	KIRREL1	Q96J84	757 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	AVP	P01185	164 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	LIPF	P07098	398 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	KIR2DS4	P43632	304 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	RAB25	P57735	213 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	KIR2DS1	Q14954	304 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		18.3	■□□□□ 0.52

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms