RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1201Q8VGF5 307 aa14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fbxo36Q9CQ24 188 aa14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ube2v2Q9D2M8 145 aa14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1157A2AVC4 312 aa14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp160E9Q459 650 aa14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Smr2O09133 150 aa14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cd7P50283 210 aa14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hist1h2baP70696 127 aa14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nkain3Q3URJ8 181 aa14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 HaghQ99KB8 309 aa14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem33Q9CR67 247 aa14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bola1Q9D8S9 137 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eif3iQ9QZD9 325 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cbfa2t3O54972 620 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tlx3O55144 291 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpr33O88416 339 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MyogP12979 224 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PtgfrP43117 366 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eif1P48024 113 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam196aQ3USH1 422 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cd200r5Q8BTP3 270 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc16a13Q8CE94 428 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cmc2Q8K199 79 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr830Q8VFJ5 315 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1459Q8VFV9 307 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gjc3Q921C1 269 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MpiQ924M7 423 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NosipQ9D6T0 301 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1532-ps1A0A0R4J8U2 307 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm14403A2BFU4 402 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr707K7N662 307 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 C3ar1O09047 477 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P01795 144 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gabrg3P27681 467 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rab3dP35276 219 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tex52Q3TTI8 308 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pate2Q3UW31 111 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sat2Q6P8J2 170 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tbl1xr1Q8BHJ5 514 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 JkampQ8BI36 311 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nmnat2Q8BNJ3 307 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpr89aQ8BS95 455 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RtbdnQ8QZY4 247 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Taf9Q8VI33 264 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Memo1Q91VH6 297 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gins3Q9CY94 216 aa14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ighv1-78A0A0G2JGN3 117 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Igkv12-89A0A0G2JGW8 112 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prr22F6TNE3 422 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Yjefn3F6W8I0 251 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 VegfdP97946 358 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BaxQ07813 192 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pla2g3Q8BZT7 504 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp87Q8K2A4 540 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r193Q8R258 319 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r217Q8R270 298 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sco2Q8VCL2 255 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr24Q8VFM9 313 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 DohhQ99LN9 302 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tbx15O70306 602 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bcl6bO88282 474 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Scd2P13011 358 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Igfbp1P47876 272 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GcdhQ60759 438 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdadc1Q8BMD5 523 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r226Q8R2A8 298 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1270Q8VGP3 304 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nmnat3Q99JR6 245 aa14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mrps30Q9D0G0 442 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AtmQ62388 3066 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm17657E9PWY5 170 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr635K7N6B1 321 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adh1P00329 375 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cxcl10P17515 98 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Klhl8P59280 629 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem18Q3TUD9 140 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 McidasQ3UZ45 379 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdr34Q5U4F6 535 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr506Q7TRU6 314 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Parp11Q8CFF0 331 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r8Q8R2C2 303 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tomm40lQ9CZR3 308 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SlirpQ9D8T7 112 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dusp13Q9QYJ7 198 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Akirin2B1AXD8 201 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc25a4P48962 298 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnase1P49183 284 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r181Q0P547 304 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Jsrp1Q3MI48 332 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SordQ64442 357 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 EnkurQ6SP97 255 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Clvs2Q8BG92 327 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prrg4Q8BGN6 226 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r36Q8R2E3 305 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q8WUR0 141 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 UmodQ91X17 642 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdr77Q99J09 342 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rab25Q9WTL2 213 aa14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trav15d-1-dv6d-1A0A075B624 124 aa14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 4930435E12RikA6X8Z9 381 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55.9 ms